More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4357 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4357  30S ribosomal protein S16  100 
 
 
86 aa  174  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  9.29169e-15  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1143  30S ribosomal protein S16  90.7 
 
 
86 aa  160  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0121256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2536  SSU ribosomal protein S16P  83.33 
 
 
141 aa  141  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  5.71366e-08  decreased coverage  0.00236598 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1956  30S ribosomal protein S16  81.71 
 
 
82 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1983  30S ribosomal protein S16  81.71 
 
 
82 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  4.39019e-07  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5264  30S ribosomal protein S16  81.71 
 
 
82 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1772  30S ribosomal protein S16  78.05 
 
 
82 aa  134  3e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2772  30S ribosomal protein S16  79.27 
 
 
82 aa  131  2e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.48934 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13321  30S ribosomal protein S16  67.5 
 
 
125 aa  119  2e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.257146  normal  0.676995 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14841  30S ribosomal protein S16  67.5 
 
 
121 aa  117  5e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321531  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0883  30S ribosomal protein S16  65.88 
 
 
135 aa  116  8e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738027  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19551  30S ribosomal protein S16  65.88 
 
 
122 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.669471 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14461  30S ribosomal protein S16  68.35 
 
 
114 aa  116  1e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1516  30S ribosomal protein S16  67.5 
 
 
130 aa  115  2e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14701  30S ribosomal protein S16  66.25 
 
 
121 aa  115  2e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0852  30S ribosomal protein S16  67.09 
 
 
110 aa  115  2e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17051  30S ribosomal protein S16  67.09 
 
 
110 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.701921  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1381  30S ribosomal protein S16  67.09 
 
 
121 aa  114  4e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  58.67 
 
 
79 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  56 
 
 
79 aa  87  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  54.67 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf245  ribosomal protein S16  47.56 
 
 
85 aa  80.9  5e-15  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00213273  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1092  ribosomal protein S16  48.84 
 
 
119 aa  80.9  5e-15  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.61695e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  50 
 
 
81 aa  78.6  2e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 
108 aa  79.3  2e-14  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  47.62 
 
 
93 aa  78.2  3e-14  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 
183 aa  77.8  4e-14  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 
90 aa  76.3  1e-13  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.23604e-28 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1863  ribosomal protein S16  43.53 
 
 
89 aa  75.5  2e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  6.17647e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  45.12 
 
 
95 aa  75.9  2e-13  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  5.87393e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  47.44 
 
 
88 aa  75.9  2e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  45.12 
 
 
95 aa  75.9  2e-13  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  8.88168e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 
90 aa  74.7  4e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.932e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 
86 aa  74.3  6e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.616e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  50 
 
 
191 aa  74.3  6e-13  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1447  ribosomal protein S16  45.24 
 
 
88 aa  73.6  9e-13  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  48.72 
 
 
82 aa  73.6  9e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  46.51 
 
 
92 aa  73.2  1e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  41.46 
 
 
90 aa  72.8  1e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  46.05 
 
 
81 aa  72.4  2e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.92366e-06  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  41.98 
 
 
87 aa  72  2e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  8.01266e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  45 
 
 
91 aa  72  2e-12  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  6.77791e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  43.75 
 
 
90 aa  72.4  2e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.7425e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  44.3 
 
 
81 aa  72  3e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.78806e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 
188 aa  71.6  3e-12  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  43.75 
 
 
90 aa  71.6  3e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.39404e-10  unclonable  4.27046e-26 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 
81 aa  72  3e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.69081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  45 
 
 
90 aa  71.6  3e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  44.3 
 
 
81 aa  71.6  3e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.4377e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 
89 aa  71.6  4e-12  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.64239e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  43.9 
 
 
90 aa  71.2  4e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.01615e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  43.37 
 
 
95 aa  71.2  5e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  2.94952e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  43.21 
 
 
88 aa  70.9  5e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  45 
 
 
82 aa  70.1  9e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.01445e-08  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  7.6365e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  43.21 
 
 
91 aa  69.3  1e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  4.3058e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.52128e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  43.21 
 
 
91 aa  69.3  1e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  3.3965e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.51748e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  44.94 
 
 
91 aa  69.7  1e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  5.25288e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  7.93752e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.44012e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.6513e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  5.28742e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  43.21 
 
 
96 aa  69.3  2e-11  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  2.68891e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  43.59 
 
 
81 aa  68.9  2e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  40.7 
 
 
88 aa  68.2  3e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  4.08452e-13  hitchhiker  5.16516e-07 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  39.02 
 
 
88 aa  67.8  4e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  42.5 
 
 
139 aa  67.8  5e-11  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  2.09071e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 
81 aa  67.4  6e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 
81 aa  67.4  6e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  40.51 
 
 
111 aa  67  7e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  8.4035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 
86 aa  67  8e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  38.37 
 
 
88 aa  67  8e-11  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.0648e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 
86 aa  67  8e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  47.3 
 
 
86 aa  66.6  1e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  4.30382e-05  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0665  30S ribosomal protein S16  35.37 
 
 
101 aa  66.2  1e-10  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  2.70999e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  47.3 
 
 
86 aa  66.6  1e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  2.65446e-06  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  40.74 
 
 
83 aa  66.2  1e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  41.56 
 
 
86 aa  66.6  1e-10  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  43.84 
 
 
81 aa  66.6  1e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  3.3138e-07  unclonable  1.37998e-09 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  40.96 
 
 
95 aa  66.6  1e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  41.46 
 
 
91 aa  66.2  1e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  40.24 
 
 
85 aa  65.9  2e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  40.54 
 
 
80 aa  65.1  3e-10  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  4.91979e-09  decreased coverage  3.78635e-12 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 
197 aa  65.1  3e-10  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  38.82 
 
 
88 aa  64.7  4e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.44609e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
90 aa  64.7  4e-10  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.48464e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  42.31 
 
 
146 aa  64.3  6e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  44.87 
 
 
186 aa  63.9  7e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  39.53 
 
 
168 aa  63.9  7e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  42.86 
 
 
121 aa  63.2  1e-09  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  38.37 
 
 
146 aa  63.2  1e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  45.95 
 
 
156 aa  63.2  1e-09  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  41.38 
 
 
157 aa  63.2  1e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  37.93 
 
 
136 aa  63.2  1e-09  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  2.45762e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  38.37 
 
 
136 aa  62.8  1e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.17151e-11 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>