More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4245 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  76.77 
 
 
399 aa  639  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  77.04 
 
 
400 aa  639  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  78.95 
 
 
400 aa  667  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  100 
 
 
398 aa  818  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  75 
 
 
402 aa  621  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  75.51 
 
 
401 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  75.51 
 
 
401 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  74.81 
 
 
401 aa  611  1e-174  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  64.94 
 
 
389 aa  529  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  64.16 
 
 
389 aa  521  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  64.16 
 
 
389 aa  521  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  64.92 
 
 
396 aa  521  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  63.61 
 
 
404 aa  517  1e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  62.02 
 
 
391 aa  506  1e-142  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  60.47 
 
 
391 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  61.52 
 
 
393 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  62.83 
 
 
400 aa  503  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  61.46 
 
 
384 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  60.26 
 
 
391 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  60.31 
 
 
407 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  62.86 
 
 
394 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  62.5 
 
 
402 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  62.14 
 
 
402 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  60.78 
 
 
388 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  62.53 
 
 
397 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  9.44956e-06 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  60.98 
 
 
404 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  59.38 
 
 
400 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  57.59 
 
 
386 aa  468  1e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  57.87 
 
 
402 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  58.22 
 
 
400 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  59.17 
 
 
400 aa  447  1e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  57.18 
 
 
388 aa  445  1e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  56.85 
 
 
387 aa  440  1e-122  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  61.58 
 
 
404 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  54.52 
 
 
396 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.40569e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  54.78 
 
 
387 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  55.3 
 
 
388 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  56.25 
 
 
397 aa  417  1e-115  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  51.97 
 
 
399 aa  405  1e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  52.23 
 
 
384 aa  406  1e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  51.97 
 
 
384 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  50.13 
 
 
392 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  52.23 
 
 
398 aa  399  1e-110  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  53.46 
 
 
379 aa  400  1e-110  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  51.38 
 
 
410 aa  400  1e-110  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  51.44 
 
 
404 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  51.66 
 
 
407 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  54.96 
 
 
404 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  51.3 
 
 
398 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.01074e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  50.38 
 
 
398 aa  388  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  50.38 
 
 
398 aa  388  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  49.61 
 
 
414 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.61511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  51.44 
 
 
392 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  52.36 
 
 
396 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  49.75 
 
 
400 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  50.63 
 
 
407 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  50.52 
 
 
393 aa  378  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 
396 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  49.35 
 
 
402 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  6.04426e-06 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  50.65 
 
 
390 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  48.3 
 
 
388 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.31678e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  49.74 
 
 
398 aa  375  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  51.59 
 
 
378 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  48.16 
 
 
394 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  49.74 
 
 
398 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  50 
 
 
392 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  48.16 
 
 
382 aa  366  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  48.28 
 
 
382 aa  363  3e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  48.29 
 
 
394 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.84465e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  47.51 
 
 
403 aa  361  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  49.34 
 
 
394 aa  356  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  45.53 
 
 
389 aa  354  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  50.26 
 
 
405 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  47.69 
 
 
396 aa  353  4e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  48.44 
 
 
403 aa  352  6e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  47.03 
 
 
394 aa  349  6e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  46.95 
 
 
395 aa  348  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  46.41 
 
 
409 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  47.92 
 
 
417 aa  347  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  49.09 
 
 
507 aa  345  6e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  51.45 
 
 
380 aa  345  6e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  47.91 
 
 
386 aa  345  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  47.11 
 
 
393 aa  344  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  46.7 
 
 
383 aa  343  4e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  49.74 
 
 
380 aa  342  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  49.87 
 
 
385 aa  341  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  45.91 
 
 
383 aa  340  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  47.78 
 
 
404 aa  340  3e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  47.69 
 
 
395 aa  338  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  45.97 
 
 
436 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  45.97 
 
 
436 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  46.86 
 
 
388 aa  338  1e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  45.71 
 
 
403 aa  337  2e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  43.85 
 
 
406 aa  337  2e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  45.71 
 
 
403 aa  337  3e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  45.71 
 
 
405 aa  336  4e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  46.88 
 
 
404 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  46.88 
 
 
404 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  47.46 
 
 
502 aa  334  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  43.49 
 
 
401 aa  333  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>