More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4234 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 284 aa  584  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  85.92 
 
 		 284 aa  510  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  76.68 
 
 		 284 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  75.27 
 
 		 284 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  75.27 
 
 		 284 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  73.14 
 
 		 284 aa  451  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  62.06 
 
 		 289 aa  364  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  59.72 
 
 		 284 aa  357  9e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  56.58 
 
 		 296 aa  341  8e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  58.01 
 
 		 284 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 		 284 aa  338  7e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 		 292 aa  338  9e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 		 284 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  56.89 
 
 		 284 aa  335  3.9999999999999995e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 		 284 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30021  formyltetrahydrofolate deformylase  57.97 
 
 		 296 aa  331  9e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53116 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  52.63 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  57.55 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  56.54 
 
 		 285 aa  328  7e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 		 284 aa  326  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 296 aa  325  6e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  53.52 
 
 		 288 aa  325  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 		 309 aa  323  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  54.93 
 
 		 290 aa  322  3e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  53.17 
 
 		 284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  52.52 
 
 		 288 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 		 293 aa  311  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  54.09 
 
 		 295 aa  310  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 300 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  52.96 
 
 		 286 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  52.96 
 
 		 286 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  53.33 
 
 		 286 aa  305  4.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  52.96 
 
 		 299 aa  303  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  52.31 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  51.93 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 300 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 284 aa  298  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  51.76 
 
 		 285 aa  295  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  50.17 
 
 		 286 aa  289  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 289 aa  290  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  49.1 
 
 		 297 aa  287  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  46.67 
 
 		 290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 		 284 aa  280  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 		 284 aa  278  1e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  47.16 
 
 		 282 aa  277  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 289 aa  275  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 		 282 aa  275  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  46.93 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 283 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  46.98 
 
 		 284 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  46.62 
 
 		 283 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 		 285 aa  271  6e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 297 aa  271  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  46.62 
 
 		 283 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  45.92 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 283 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 283 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 283 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 283 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  47.72 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  48.96 
 
 		 284 aa  265  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44906  formyltetrahydrofolate deformylase  46.48 
 
 		 304 aa  265  5.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 		 287 aa  265  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  45.26 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  44.88 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  47.65 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.21 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  46.64 
 
 		 283 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  46.07 
 
 		 283 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  46.5 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 		 287 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  45.23 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  44.52 
 
 		 283 aa  258  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  45.32 
 
 		 287 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  44.84 
 
 		 287 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  46.34 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  45.49 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  45.52 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  45.71 
 
 		 296 aa  255  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  45.13 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  47.29 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  46.29 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  44.67 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 		 285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  46.62 
 
 		 283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  45.39 
 
 		 284 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  44.77 
 
 		 282 aa  252  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  46.59 
 
 		 291 aa  251  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>