83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4224 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4224  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 
252 aa  507  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.851728  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1454  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  70.24 
 
 
252 aa  378  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3559  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.5 
 
 
254 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0529  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.8 
 
 
249 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0546  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase-like protein  31.8 
 
 
249 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4023  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.99 
 
 
260 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3577  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.55 
 
 
248 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1353  hypothetical protein  29.36 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562603  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1838  hypothetical protein  36.55 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20991  hypothetical protein  27.19 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.449797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2846  hypothetical protein  27.73 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3275  hypothetical protein  27.73 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4385  hypothetical protein  26.07 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.016831 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0024  hypothetical protein  33.09 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00871  hypothetical protein  26.85 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0216  hypothetical protein  32.86 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4001  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.6 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0412  hypothetical protein  25.52 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1601  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.4 
 
 
635 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0474  putative peptidyl-prolyl isomerase  24.6 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139387  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2528  hypothetical protein  35.88 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.333422  normal  0.549584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0928  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.7 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.496097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2682  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.47 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0223  hypothetical protein  28.42 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000261911  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3421  hypothetical protein  24.47 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1223  hypothetical protein  25.23 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102952  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3511  hypothetical protein  23.45 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1844  hypothetical protein  31.47 
 
 
237 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3835  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.2 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.834498 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0634  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.56 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137555  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1906  hypothetical protein  22.27 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.659216 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0730  hypothetical protein  22.59 
 
 
261 aa  58.9  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4381  hypothetical protein  23.73 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01301  hypothetical protein  23.55 
 
 
256 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.627797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1660  hypothetical protein  31.47 
 
 
237 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000295507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1130  hypothetical protein  31.29 
 
 
581 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1000  hypothetical protein  31.29 
 
 
581 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00918654  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0911  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.32 
 
 
354 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.159559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1066  peptidylprolyl isomerase  28.19 
 
 
285 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0966  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.54 
 
 
359 aa  50.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000363046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1320  peptidylprolyl isomerase  27.52 
 
 
285 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1280  peptidylprolyl isomerase  27.52 
 
 
285 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2985  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.1 
 
 
620 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0090  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  27.93 
 
 
307 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0103  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.65 
 
 
632 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199337  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2527  SurA domain-containing protein  32.77 
 
 
452 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1243  peptidylprolyl isomerase  27.52 
 
 
285 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1168  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.8 
 
 
286 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4126  peptidylprolyl isomerase  26.85 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.174381  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1169  peptidylprolyl isomerase  27.52 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1476  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.32 
 
 
446 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1084  peptidylprolyl isomerase  27.52 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0888  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.71 
 
 
456 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0501043  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2106  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.41 
 
 
93 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2830  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.8 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1061  peptidylprolyl isomerase  27.52 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0659  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.42 
 
 
324 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0116  hypothetical protein  26.87 
 
 
246 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0887  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.37 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0142655  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2037  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  24.52 
 
 
329 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1070  peptidylprolyl isomerase  27.54 
 
 
285 aa  45.4  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1215  peptidylprolyl isomerase  26.17 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.34 
 
 
324 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000367752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0410  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.95 
 
 
446 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0155  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.14 
 
 
111 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891908  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1441  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.97 
 
 
558 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0253  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  30 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0141  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.47 
 
 
310 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000469336  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5022  hypothetical protein  22.65 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3008  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.49 
 
 
92 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0198  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.34 
 
 
336 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000154337 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0594  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.79 
 
 
301 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1314  hypothetical protein  30.23 
 
 
93 aa  43.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0952  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.17 
 
 
92 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3588  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.37 
 
 
300 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000961276  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0643  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.57 
 
 
276 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221486  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0106  foldase protein PrsA  27.46 
 
 
299 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.89 
 
 
323 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137747  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2760  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.81 
 
 
284 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2916  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.62 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438162  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3276  hypothetical protein  28.57 
 
 
102 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2543  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.33 
 
 
93 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1460  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.57 
 
 
281 aa  42  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>