74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4175 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  70.31 
 
 		 194 aa  299  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  38.27 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  38.46 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  37.5 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.25 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  36.51 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  37.43 
 
 		 214 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.05 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  37.57 
 
 		 255 aa  131  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  37.7 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  37.77 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  36.17 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  37.23 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  36.41 
 
 		 545 aa  128  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  35.42 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.81 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.67 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  31.28 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.6 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  32.29 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.87 
 
 		 544 aa  124  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  34.72 
 
 		 218 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  34.04 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  35.33 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  33.51 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  36.7 
 
 		 228 aa  117  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  35.64 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  32.09 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  36.81 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.84 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  32 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.15 
 
 		 208 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.52 
 
 		 559 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.07 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  32.52 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  31.94 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  31.58 
 
 		 553 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.8 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  33.16 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.39 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  32.18 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  30.77 
 
 		 223 aa  98.6  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  29.23 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.02 
 
 		 550 aa  97.1  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.78 
 
 		 570 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  28.72 
 
 		 222 aa  95.5  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.83 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.96 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  27.53 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  28.11 
 
 		 598 aa  82  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  30.1 
 
 		 594 aa  82  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.78 
 
 		 580 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  27.78 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.34 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  24.74 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  27.27 
 
 		 558 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.56 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.13 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.41 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1930  hypothetical protein  26.61 
 
 		 272 aa  53.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  30.25 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  26.89 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0438  hypothetical protein  26.28 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.503828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  27.73 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0136  hypothetical protein  23.33 
 
 		 231 aa  45.1  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2060  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.456181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  28.33 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.58 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.45 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.5 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_256  UvrD/REP helicase  30.59 
 
 		 972 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000753871  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  27.5 
 
 		 446 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  29.75 
 
 		 171 aa  41.2  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>