More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4156 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  100 
 
 
461 aa  940    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  48.68 
 
 
455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  50.55 
 
 
455 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  50.66 
 
 
457 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  49.78 
 
 
458 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  49.23 
 
 
456 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  49.23 
 
 
456 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  50.11 
 
 
454 aa  430  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  49.02 
 
 
461 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  48.24 
 
 
463 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  48.45 
 
 
454 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  47.46 
 
 
456 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  49.67 
 
 
456 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  49.13 
 
 
462 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  48.8 
 
 
464 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  47.51 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  47.69 
 
 
463 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  48.02 
 
 
456 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  49.13 
 
 
464 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  48.05 
 
 
464 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  49.02 
 
 
455 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  49.22 
 
 
469 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  46.92 
 
 
468 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  48.01 
 
 
460 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  48.14 
 
 
464 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  46.58 
 
 
468 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  46.67 
 
 
464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  46.83 
 
 
464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  46.94 
 
 
458 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  46.61 
 
 
464 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  46.61 
 
 
464 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  44.3 
 
 
459 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.08 
 
 
459 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.08 
 
 
459 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.64 
 
 
459 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  46.09 
 
 
465 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  44.9 
 
 
463 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  53.56 
 
 
332 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.41 
 
 
453 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  46.17 
 
 
462 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  59.57 
 
 
326 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  44.22 
 
 
459 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.2 
 
 
496 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  58.07 
 
 
326 aa  356  5.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  41.7 
 
 
479 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  53.74 
 
 
355 aa  353  5e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.59 
 
 
465 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  40.27 
 
 
521 aa  346  4e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  40.44 
 
 
453 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  40.94 
 
 
457 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  40.72 
 
 
457 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  42.21 
 
 
465 aa  342  8e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.54 
 
 
456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  41.54 
 
 
464 aa  335  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  42.71 
 
 
494 aa  330  4e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  38.84 
 
 
454 aa  330  4e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  47.21 
 
 
469 aa  325  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.6 
 
 
479 aa  321  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  48.16 
 
 
326 aa  318  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  40.56 
 
 
456 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  54.49 
 
 
316 aa  314  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  54.49 
 
 
316 aa  314  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  45.37 
 
 
345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  40.58 
 
 
464 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  45.06 
 
 
346 aa  306  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40 
 
 
461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.8 
 
 
456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.56 
 
 
455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  37.31 
 
 
456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.78 
 
 
461 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  50.46 
 
 
535 aa  298  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  35.19 
 
 
457 aa  294  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  51.12 
 
 
316 aa  294  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  49.19 
 
 
310 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  49.19 
 
 
310 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.58 
 
 
333 aa  293  4e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  48.85 
 
 
310 aa  291  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  49.34 
 
 
312 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  50.8 
 
 
316 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  48.36 
 
 
312 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  45.85 
 
 
324 aa  286  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  32.52 
 
 
466 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  45.34 
 
 
325 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  45.03 
 
 
324 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  45.23 
 
 
324 aa  282  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  51 
 
 
302 aa  282  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  44.44 
 
 
340 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  44.1 
 
 
334 aa  276  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  47.02 
 
 
302 aa  276  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  42.72 
 
 
331 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  47.85 
 
 
311 aa  270  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.33 
 
 
302 aa  270  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  43.79 
 
 
324 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  46.67 
 
 
327 aa  269  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  46.71 
 
 
304 aa  269  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  47.28 
 
 
308 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  47.88 
 
 
308 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  49.02 
 
 
309 aa  266  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  45.07 
 
 
320 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  43.08 
 
 
325 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>