101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4140 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  100 
 
 		 600 aa  1216    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  39.93 
 
 		 531 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  40.15 
 
 		 563 aa  346  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  39.78 
 
 		 533 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  36.52 
 
 		 574 aa  333  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  40.81 
 
 		 529 aa  332  8e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  37.86 
 
 		 581 aa  324  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  36.67 
 
 		 561 aa  321  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  34.44 
 
 		 639 aa  306  6e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  37.95 
 
 		 530 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  37.08 
 
 		 550 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  36.81 
 
 		 542 aa  296  7e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  35.75 
 
 		 539 aa  292  9e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  37.4 
 
 		 491 aa  287  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  36.41 
 
 		 604 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  37.16 
 
 		 550 aa  280  6e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  32.24 
 
 		 641 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  33.55 
 
 		 572 aa  274  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  34.1 
 
 		 622 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  33.77 
 
 		 551 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  35.23 
 
 		 571 aa  256  6e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  33.53 
 
 		 658 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  33.88 
 
 		 624 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  35.35 
 
 		 606 aa  247  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 508 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  30.28 
 
 		 593 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  31.06 
 
 		 591 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  29.34 
 
 		 581 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  29.34 
 
 		 581 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  34.42 
 
 		 543 aa  220  6e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  28.01 
 
 		 666 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  28.01 
 
 		 666 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  32.16 
 
 		 645 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  29.45 
 
 		 589 aa  213  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  33.33 
 
 		 548 aa  209  8e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  30.3 
 
 		 586 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  30.3 
 
 		 586 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  32.17 
 
 		 518 aa  206  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  31.8 
 
 		 632 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  30.31 
 
 		 531 aa  191  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  32.14 
 
 		 578 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  30.83 
 
 		 510 aa  182  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  30.21 
 
 		 643 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  28.49 
 
 		 524 aa  177  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  29.41 
 
 		 513 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  29.2 
 
 		 543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  29.8 
 
 		 568 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  28.44 
 
 		 531 aa  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  28.52 
 
 		 555 aa  163  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  27.2 
 
 		 514 aa  162  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  47.72 
 
 		 629 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  29.41 
 
 		 500 aa  160  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  29.08 
 
 		 561 aa  157  4e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  34.72 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  28.49 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  39.66 
 
 		 518 aa  151  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  30.2 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  44.12 
 
 		 188 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  32.81 
 
 		 544 aa  124  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  35.63 
 
 		 515 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  46.32 
 
 		 261 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  35.06 
 
 		 515 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  27.27 
 
 		 450 aa  88.2  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  50 
 
 		 262 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  50 
 
 		 262 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  28.44 
 
 		 449 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  23.62 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  23.45 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  24.42 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  27.27 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  34.95 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  23.19 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  34.17 
 
 		 673 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  36.94 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  28.44 
 
 		 255 aa  55.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  32.43 
 
 		 946 aa  54.7  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  33 
 
 		 932 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  32.39 
 
 		 426 aa  51.2  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  34.69 
 
 		 919 aa  50.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  29.63 
 
 		 385 aa  50.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  41.38 
 
 		 413 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  27.07 
 
 		 186 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  39.39 
 
 		 400 aa  48.5  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  30.91 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  28.57 
 
 		 432 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  42.59 
 
 		 400 aa  47.4  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  41.51 
 
 		 414 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  28.83 
 
 		 361 aa  47  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  40.74 
 
 		 1821 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  40 
 
 		 756 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  28.3 
 
 		 343 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  37.1 
 
 		 441 aa  46.2  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  42.37 
 
 		 575 aa  46.2  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  28.47 
 
 		 371 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  35.21 
 
 		 506 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  30.65 
 
 		 526 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  37.78 
 
 		 1036 aa  45.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  30.56 
 
 		 330 aa  45.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  53.49 
 
 		 548 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  51.06 
 
 		 457 aa  43.9  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>