More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4108 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  38.94 
 
 
4268 aa  1023    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  44.83 
 
 
6889 aa  1261    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  40.7 
 
 
2719 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  41.51 
 
 
2066 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  41.57 
 
 
1955 aa  719    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  47.44 
 
 
2232 aa  826    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  30.26 
 
 
2316 aa  638    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  43.2 
 
 
7279 aa  693    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  54.87 
 
 
2791 aa  721    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  41.24 
 
 
1424 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  44.27 
 
 
1537 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.69 
 
 
2551 aa  1064    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.82 
 
 
1874 aa  1027    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1656 aa  3427    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  46.49 
 
 
1144 aa  772    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  54.9 
 
 
1587 aa  1049    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  40.11 
 
 
1646 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  42.74 
 
 
1832 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  44.43 
 
 
1548 aa  690    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  47.97 
 
 
2880 aa  847    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  51.98 
 
 
1559 aa  966    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  43.93 
 
 
3254 aa  738    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  53.55 
 
 
2103 aa  1337    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  43.73 
 
 
3252 aa  791    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  40.62 
 
 
1574 aa  641    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  42.29 
 
 
1939 aa  794    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  46.73 
 
 
2604 aa  741    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  37.12 
 
 
3508 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  39.04 
 
 
2081 aa  687    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  40.32 
 
 
1402 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  41.26 
 
 
3111 aa  680    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  40.5 
 
 
4165 aa  1064    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  43.04 
 
 
2943 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  34.46 
 
 
3718 aa  854    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  42.95 
 
 
1602 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  40.06 
 
 
2024 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  44.77 
 
 
3693 aa  839    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  40.28 
 
 
3033 aa  671    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  42.76 
 
 
1520 aa  648    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  44.22 
 
 
1190 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  42.47 
 
 
1580 aa  687    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  47.8 
 
 
2230 aa  801    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  43.73 
 
 
2333 aa  815    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  40.63 
 
 
2126 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  53.53 
 
 
614 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  52.14 
 
 
991 aa  726    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  57.26 
 
 
596 aa  714    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  48.66 
 
 
2551 aa  900    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  45.83 
 
 
1909 aa  807    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  49.23 
 
 
1354 aa  924    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  42.02 
 
 
2985 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  47.63 
 
 
3645 aa  817    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  49.39 
 
 
1349 aa  908    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  42.54 
 
 
4151 aa  699    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  48.22 
 
 
4478 aa  881    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  47.74 
 
 
1474 aa  1172    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 
5154 aa  731    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  43.23 
 
 
2047 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  44.77 
 
 
3693 aa  839    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  41.77 
 
 
3463 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  42.76 
 
 
1520 aa  648    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  44.22 
 
 
1190 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  42.47 
 
 
1580 aa  687    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  40.4 
 
 
1789 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  48.74 
 
 
3099 aa  890    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  45.35 
 
 
3676 aa  840    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  47.33 
 
 
2477 aa  806    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  45.2 
 
 
3696 aa  850    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  41.72 
 
 
1827 aa  662    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  41.77 
 
 
1805 aa  667    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  55.91 
 
 
725 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  41.36 
 
 
1581 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  41.6 
 
 
1828 aa  693    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  42.82 
 
 
2367 aa  658    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  39.92 
 
 
3494 aa  690    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  56.39 
 
 
1337 aa  1009    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  40.08 
 
 
5255 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  40.97 
 
 
2220 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  32.59 
 
 
3099 aa  831    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  44.38 
 
 
3130 aa  771    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  47.84 
 
 
3176 aa  887    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  44.77 
 
 
3702 aa  839    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  34.7 
 
 
2376 aa  739    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  44.22 
 
 
1190 aa  648    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  42.83 
 
 
1580 aa  687    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  41.99 
 
 
3101 aa  684    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  34.3 
 
 
2374 aa  739    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  41.5 
 
 
2498 aa  646    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  53.99 
 
 
1087 aa  1037    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  40.16 
 
 
3711 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  39.33 
 
 
3158 aa  699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  44.91 
 
 
3679 aa  835    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  34.68 
 
 
4101 aa  805    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  42.98 
 
 
1876 aa  666    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  41.37 
 
 
1806 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  56.41 
 
 
611 aa  704    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  42.76 
 
 
1577 aa  684    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  41.5 
 
 
1823 aa  671    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  55.04 
 
 
2762 aa  1766    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  41.91 
 
 
7210 aa  731    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>