112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4059 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  100 
 
 		 581 aa  1174    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  48.04 
 
 		 542 aa  493  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  48.9 
 
 		 539 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  47.45 
 
 		 531 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  47.49 
 
 		 491 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  45.01 
 
 		 530 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  44.07 
 
 		 563 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  43.55 
 
 		 658 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  46.09 
 
 		 529 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  43.49 
 
 		 550 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  44.6 
 
 		 622 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  42.13 
 
 		 639 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  40.8 
 
 		 533 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  41.15 
 
 		 581 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  41.15 
 
 		 581 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  43.47 
 
 		 572 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  40 
 
 		 561 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  39.53 
 
 		 574 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  42.12 
 
 		 624 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  40.51 
 
 		 591 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  40.98 
 
 		 593 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  39.31 
 
 		 571 aa  353  5e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  40.83 
 
 		 586 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  40.83 
 
 		 586 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  37.46 
 
 		 508 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  37.67 
 
 		 551 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  38.94 
 
 		 604 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  37.83 
 
 		 589 aa  332  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  38.73 
 
 		 550 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  37.86 
 
 		 600 aa  324  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  34.9 
 
 		 641 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  35.83 
 
 		 606 aa  289  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  37.71 
 
 		 645 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  37.27 
 
 		 643 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  35.82 
 
 		 632 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  37.14 
 
 		 531 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  30.8 
 
 		 666 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  30.8 
 
 		 666 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  35.6 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  35.78 
 
 		 543 aa  244  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  35.3 
 
 		 548 aa  239  8e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  31.58 
 
 		 500 aa  225  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  32.25 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  32.21 
 
 		 510 aa  221  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  32.29 
 
 		 543 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  32.17 
 
 		 524 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  31.81 
 
 		 514 aa  212  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  33.06 
 
 		 531 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  32.92 
 
 		 578 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  33.86 
 
 		 528 aa  201  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  31.12 
 
 		 518 aa  197  6e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  31.99 
 
 		 561 aa  196  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  41.24 
 
 		 555 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  30.92 
 
 		 568 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  44.91 
 
 		 475 aa  178  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  30.43 
 
 		 544 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  30.39 
 
 		 527 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  51.85 
 
 		 188 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  24.96 
 
 		 515 aa  115  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  25.64 
 
 		 515 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  42.15 
 
 		 261 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  47.13 
 
 		 262 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  47.13 
 
 		 262 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  30.42 
 
 		 450 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  24.89 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  23.01 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  25.14 
 
 		 449 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  22.05 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  24.29 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  22.29 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  35.29 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  25.97 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  39.39 
 
 		 946 aa  62.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  23.1 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  58.7 
 
 		 629 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  33.33 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  21.79 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  34.41 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  35.58 
 
 		 932 aa  57  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  34.17 
 
 		 673 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  22.56 
 
 		 415 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  29.27 
 
 		 432 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  35.29 
 
 		 919 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  44.44 
 
 		 1036 aa  51.2  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  29.63 
 
 		 361 aa  50.8  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  44.64 
 
 		 414 aa  50.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  44.07 
 
 		 575 aa  50.4  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  20.32 
 
 		 409 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  41.82 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  26.67 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  42.65 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.82 
 
 		 558 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  37.5 
 
 		 400 aa  47.8  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  36.11 
 
 		 784 aa  47.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  40.74 
 
 		 400 aa  47.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  26.56 
 
 		 335 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  25.44 
 
 		 424 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  29.41 
 
 		 186 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  47.73 
 
 		 548 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  40 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>