More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4027 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1551  nitrogenase, subunit K  64.73 
 
 
462 aa  651    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  73.28 
 
 
461 aa  724    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  100 
 
 
463 aa  951    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1392  nitrogenase  63.66 
 
 
462 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2613  Fe-only nitrogenase, beta subunit  61.08 
 
 
462 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  60.22 
 
 
462 aa  617  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1620  Fe-only nitrogenase, beta subunit  60.34 
 
 
461 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.855819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02590  vanadium nitrogenase beta subunit, vnfK  61.72 
 
 
475 aa  609  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  57.63 
 
 
462 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  42.22 
 
 
462 aa  359  5e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  42.22 
 
 
462 aa  359  5e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  41.58 
 
 
462 aa  358  8e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  41.36 
 
 
462 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  42.7 
 
 
456 aa  350  3e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  39.87 
 
 
490 aa  342  9e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  42.89 
 
 
472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  38.24 
 
 
458 aa  326  5e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  39.82 
 
 
475 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  38.78 
 
 
458 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  38.16 
 
 
458 aa  323  4e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  39.16 
 
 
475 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  38.86 
 
 
458 aa  319  7e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  36.67 
 
 
477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.25 
 
 
458 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.84 
 
 
511 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.84 
 
 
511 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.39 
 
 
455 aa  281  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.06 
 
 
511 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.79 
 
 
461 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.81 
 
 
458 aa  277  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.09 
 
 
487 aa  276  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.35 
 
 
487 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.88 
 
 
455 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.05 
 
 
489 aa  270  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.34 
 
 
512 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.1 
 
 
487 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.54 
 
 
459 aa  268  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.43 
 
 
461 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  36.36 
 
 
461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.62 
 
 
511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.79 
 
 
487 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.6 
 
 
512 aa  265  8.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.86 
 
 
463 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.57 
 
 
487 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.62 
 
 
489 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.31 
 
 
460 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.28 
 
 
459 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  35.32 
 
 
511 aa  256  8e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.31 
 
 
512 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.78 
 
 
458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.02 
 
 
459 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.05 
 
 
489 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  33.41 
 
 
451 aa  253  7e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.29 
 
 
489 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.2 
 
 
518 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.3 
 
 
485 aa  251  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.19 
 
 
524 aa  251  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  33.48 
 
 
489 aa  249  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.73 
 
 
518 aa  249  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.31 
 
 
460 aa  249  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2621  Nitrogenase  34.42 
 
 
538 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  34.51 
 
 
456 aa  246  6e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1075  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.35 
 
 
537 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.902597  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  34.67 
 
 
519 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  32.96 
 
 
457 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  34.4 
 
 
454 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  31.13 
 
 
479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  34.44 
 
 
450 aa  243  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5099  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.55 
 
 
519 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.26 
 
 
520 aa  242  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0971  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.13 
 
 
519 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0090  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.71 
 
 
519 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.48 
 
 
523 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.48 
 
 
460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.26 
 
 
522 aa  239  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.55 
 
 
519 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1238  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.16 
 
 
519 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1520  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  34.16 
 
 
519 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268449  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.84 
 
 
523 aa  237  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.4 
 
 
522 aa  237  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3630  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.48 
 
 
519 aa  237  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4461  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.86 
 
 
518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0555  Nitrogenase  32.59 
 
 
456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1426  nitrogenase  35.23 
 
 
418 aa  234  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  34.65 
 
 
452 aa  233  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.75 
 
 
516 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.75 
 
 
506 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3536  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.19 
 
 
512 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.47 
 
 
513 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  33.11 
 
 
466 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.73 
 
 
511 aa  230  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.11 
 
 
506 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0738  nitrogenase  34 
 
 
450 aa  229  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1432  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.16 
 
 
519 aa  229  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  32.95 
 
 
450 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.97 
 
 
510 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1607  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.41 
 
 
519 aa  226  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262136  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.01 
 
 
512 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2343  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.56 
 
 
519 aa  225  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303723  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.88 
 
 
472 aa  224  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>