52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3957 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3957  NifZ  100 
 
 
95 aa  192  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  69.89 
 
 
95 aa  141  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  70.93 
 
 
88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  63.33 
 
 
104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  63.33 
 
 
104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  64.2 
 
 
88 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  61.9 
 
 
97 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  65.85 
 
 
88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  52.81 
 
 
90 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  58.82 
 
 
107 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  55.17 
 
 
99 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  55.56 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  51.09 
 
 
99 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0209  nifZ protein  52.87 
 
 
106 aa  97.1  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00067923  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  54.02 
 
 
99 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1251  NifZ family protein  51.69 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275395  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1535  NifZ domain protein  51.69 
 
 
97 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  53.41 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1573  NifZ family protein  51.81 
 
 
92 aa  93.6  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  54.32 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  53.19 
 
 
120 aa  93.6  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  54.43 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1409  NifZ family protein  56.63 
 
 
111 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  50.57 
 
 
101 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1450  hypothetical protein  49.48 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  54.79 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  54.17 
 
 
181 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7745  NifZ family protein  52.56 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7776  NifZ family protein  52.56 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357027  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  46.51 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0544  nitrogen fixation protein NifZ  48.84 
 
 
94 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2195  NifZ family protein  48.84 
 
 
94 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458852  normal  0.730387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  48.57 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1243  NifZ family protein  51.28 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.753327 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  50 
 
 
82 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  50.68 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  43.04 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  41.1 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  41.33 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  37.33 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  30.99 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  35.06 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  32.1 
 
 
85 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1451  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  33.33 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  37.84 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  32 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  33.33 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  34.67 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  34.67 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  34.25 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  30.43 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>