More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3940 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
99 aa  204  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  86.87 
 
 
99 aa  184  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  69.39 
 
 
99 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  64.71 
 
 
104 aa  141  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  74.75 
 
 
99 aa  140  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  65.35 
 
 
104 aa  136  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  63.27 
 
 
99 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  62.24 
 
 
99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  61.22 
 
 
99 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  58.95 
 
 
99 aa  128  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  58.16 
 
 
99 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  57.14 
 
 
99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  57.14 
 
 
99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  58.16 
 
 
99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  60 
 
 
104 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  60 
 
 
104 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  57.14 
 
 
99 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  57.14 
 
 
99 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  57.14 
 
 
99 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  55.1 
 
 
99 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  55.1 
 
 
99 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  54.74 
 
 
99 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  53.54 
 
 
100 aa  119  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  54.74 
 
 
99 aa  116  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  55.1 
 
 
123 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  53.06 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 
103 aa  106  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  55.1 
 
 
96 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  48.98 
 
 
106 aa  103  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  46.88 
 
 
102 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  55.84 
 
 
94 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  45.26 
 
 
94 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  46.94 
 
 
99 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  45.92 
 
 
99 aa  98.6  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  46.94 
 
 
97 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  46.81 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  55 
 
 
98 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  48.98 
 
 
268 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  41.84 
 
 
106 aa  92  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  42.11 
 
 
105 aa  89.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  54.17 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  41.3 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  41.3 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 
105 aa  84.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 
105 aa  84.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  41.94 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  38.71 
 
 
122 aa  84  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  42.42 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  35.79 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  44.09 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  42.42 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  38.71 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  46.24 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  46.84 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  42.71 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  38.71 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  47.95 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  47.95 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  38.46 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  38.95 
 
 
94 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  39.8 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  45.21 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  42.86 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  32.99 
 
 
200 aa  70.1  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  49.23 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  38.1 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1567  ferredoxin (2Fe-2S)  42.47 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  33.7 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  38.1 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1231  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.51 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.57 
 
 
358 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3739  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  44.3 
 
 
358 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184178  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  38.03 
 
 
350 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  33.33 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  40 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0814  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.28 
 
 
365 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382172  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  42.47 
 
 
358 aa  63.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0991  putative ring-hydroxylation complex protein 4  36.11 
 
 
361 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153237  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  46.15 
 
 
357 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  44.26 
 
 
358 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  45.9 
 
 
358 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3646  ferredoxin  32.61 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.77 
 
 
351 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  44.26 
 
 
358 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  44.26 
 
 
358 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  30.85 
 
 
338 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3569  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.94 
 
 
362 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.85 
 
 
338 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  42.25 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  35.48 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  39.24 
 
 
124 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  38.24 
 
 
321 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  32.97 
 
 
343 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  37.33 
 
 
366 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.33 
 
 
358 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.27 
 
 
352 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.26 
 
 
353 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  35.8 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  38.46 
 
 
353 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>