More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3823 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 
246 aa  475  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  88.62 
 
 
249 aa  412  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  78.69 
 
 
246 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  78.28 
 
 
246 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  72.92 
 
 
243 aa  349  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  74.04 
 
 
253 aa  315  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4999  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  73.55 
 
 
244 aa  301  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0323  cytochrome c biogenesis protein-like  54.92 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  41.48 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  41.48 
 
 
246 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  43.6 
 
 
218 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  40.83 
 
 
234 aa  159  6e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  43.6 
 
 
218 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16611  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  45.97 
 
 
218 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10432  predicted protein  47.03 
 
 
225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000896469  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1552  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  44.08 
 
 
218 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  42.58 
 
 
210 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2203  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  42.47 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54791  biogenesis protein  32.53 
 
 
382 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.86 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04721  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  42.86 
 
 
222 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.21 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 
228 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  34.33 
 
 
228 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.69 
 
 
223 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  32.46 
 
 
230 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  33.65 
 
 
611 aa  98.6  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.02 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3483  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.55 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.220694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.23 
 
 
228 aa  92.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  32 
 
 
230 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.23 
 
 
466 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  33.68 
 
 
471 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0588  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.78 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.31 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.800011 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.63 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.63 
 
 
471 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.37 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.17 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1899  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.06 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000193089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.51 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.6 
 
 
608 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.17 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0174  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.47 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1088  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  25.7 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1026  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.11 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.54 
 
 
449 aa  72.4  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  32.2 
 
 
629 aa  72  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  30.14 
 
 
251 aa  72  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.59 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  31.58 
 
 
623 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4058  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.25 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.39 
 
 
611 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.19 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  32.19 
 
 
630 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4125  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.44 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0162627 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  25.23 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.38 
 
 
610 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3605  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.32 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4015  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.68 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1909  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.12 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00531601  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  28.52 
 
 
586 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3645  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.5 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1218  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.62 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  28.52 
 
 
586 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  28.92 
 
 
581 aa  69.3  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.02 
 
 
604 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.38 
 
 
613 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.38 
 
 
613 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1144  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.43 
 
 
332 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0421385 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.38 
 
 
613 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.8 
 
 
624 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.54 
 
 
626 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.14 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.15 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1771  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.91 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.17 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
609 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.2 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  32.99 
 
 
610 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1698  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.29 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.6 
 
 
592 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1241  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.72 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0549817  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.17 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2782  hypothetical protein  25.28 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143596  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.59 
 
 
624 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.4 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.04 
 
 
619 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.96 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  29.47 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.04 
 
 
619 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.04 
 
 
619 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.49 
 
 
619 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.8 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0753  putative cytochrome c-type biogenesis protein  29.83 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.117718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.8 
 
 
607 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.44 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>