More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3692 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 
146 aa  298  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  85 
 
 
141 aa  250  4e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  67.81 
 
 
157 aa  210  6e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  44.68 
 
 
350 aa  123  8e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  39.1 
 
 
160 aa  116  1e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.56 
 
 
1056 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.88 
 
 
1075 aa  89.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.57 
 
 
225 aa  88.6  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
225 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  31.43 
 
 
225 aa  80.1  9e-15  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  33.33 
 
 
225 aa  79.3  1e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  31.58 
 
 
224 aa  79.3  2e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  31.43 
 
 
225 aa  78.2  3e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.33 
 
 
220 aa  78.2  3e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.47 
 
 
224 aa  77.8  4e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.09 
 
 
251 aa  77.8  5e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 
219 aa  77.4  6e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.07267e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.45 
 
 
225 aa  76.6  1e-13  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.07 
 
 
224 aa  75.1  3e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  30.83 
 
 
226 aa  75.5  3e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  34.04 
 
 
165 aa  74.3  5e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
224 aa  74.3  6e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.23 
 
 
228 aa  74.3  6e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
224 aa  73.9  6e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  35.78 
 
 
214 aa  73.9  6e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  32.03 
 
 
482 aa  73.9  7e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  32.11 
 
 
482 aa  73.9  7e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.25 
 
 
226 aa  73.6  8e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
224 aa  73.6  9e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
224 aa  72.8  1e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  32.38 
 
 
265 aa  73.2  1e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  2.22196e-09  unclonable  1.02776e-18 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
224 aa  72.8  1e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
224 aa  72.8  1e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  35.09 
 
 
224 aa  72.4  2e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.19 
 
 
231 aa  72.4  2e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
228 aa  72  2e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
226 aa  72.8  2e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  31.06 
 
 
417 aa  71.6  3e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.86 
 
 
225 aa  71.6  3e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
225 aa  71.2  4e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.3 
 
 
228 aa  71.2  4e-12  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.24 
 
 
242 aa  70.9  5e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.78 
 
 
226 aa  70.9  6e-12  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 
224 aa  70.5  7e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.9 
 
 
253 aa  70.5  7e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  27.14 
 
 
563 aa  70.5  7e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.23 
 
 
224 aa  70.5  8e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
228 aa  69.7  1e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  29.71 
 
 
243 aa  69.7  1e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  32.38 
 
 
265 aa  70.1  1e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
171 aa  69.7  1e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
169 aa  69.3  2e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 
419 aa  68.9  2e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  28.3 
 
 
124 aa  68.6  2e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  30.28 
 
 
265 aa  68.9  2e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  5.60596e-13  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
252 aa  68.2  3e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  27.74 
 
 
151 aa  68.2  3e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.69 
 
 
226 aa  68.6  3e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  37.89 
 
 
157 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  32.11 
 
 
407 aa  68.2  4e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1254  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
131 aa  68.2  4e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000276684  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  28.91 
 
 
155 aa  67.8  5e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  35.34 
 
 
161 aa  67.8  5e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  30.65 
 
 
583 aa  67.4  6e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.05 
 
 
225 aa  67.4  6e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5235  predicted protein  35.58 
 
 
263 aa  67  8e-11  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  38.95 
 
 
144 aa  67  9e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  29.85 
 
 
225 aa  66.6  1e-10  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  29.69 
 
 
154 aa  66.2  1e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  40 
 
 
158 aa  66.2  1e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  31.01 
 
 
167 aa  66.2  1e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.38 
 
 
223 aa  66.6  1e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.12 
 
 
155 aa  66.2  1e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  27.82 
 
 
148 aa  65.5  2e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
219 aa  65.5  2e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  32.98 
 
 
425 aa  65.5  2e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.98 
 
 
425 aa  65.5  2e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  29.77 
 
 
211 aa  65.1  3e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.05148e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  27.78 
 
 
222 aa  65.1  3e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  35.92 
 
 
241 aa  65.1  3e-10  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.74 
 
 
225 aa  65.1  3e-10  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  32.17 
 
 
355 aa  64.7  4e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  31.15 
 
 
212 aa  64.7  4e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  30.23 
 
 
167 aa  64.7  4e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  29.77 
 
 
211 aa  64.7  4e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.39306e-08  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  27.91 
 
 
224 aa  64.7  4e-10  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  31.5 
 
 
367 aa  64.7  4e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
228 aa  64.3  5e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.62 
 
 
224 aa  64.3  5e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  32.46 
 
 
224 aa  64.3  5e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  25.78 
 
 
164 aa  64.3  6e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.63 
 
 
215 aa  63.9  6e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  26.28 
 
 
226 aa  64.3  6e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.34 
 
 
220 aa  63.9  7e-10  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  1.48221e-05 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  31.2 
 
 
211 aa  63.9  7e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.12 
 
 
227 aa  63.9  7e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  29.75 
 
 
214 aa  63.9  7e-10  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  30.58 
 
 
210 aa  63.5  8e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  31.4 
 
 
210 aa  63.5  8e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  30.58 
 
 
210 aa  63.2  1e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>