78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3644 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 		 340 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  57.96 
 
 		 332 aa  345  7e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1457  CsgG family protein, putative  48.26 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2162  curli production assembly/transport component CsgG  35.9 
 
 		 327 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  31.2 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  31.64 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  31.27 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  27.09 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0374  Curli production assembly/transport component CsgG  27.95 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  32.09 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1717  curli production assembly/transport component CsgG  36.84 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000937383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  29.3 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15901  hypothetical protein  33.09 
 
 		 275 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1105  Curli production assembly/transport component CsgG  37.5 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  27.93 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1518  Curli production assembly/transport component CsgG  35 
 
 		 209 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284024  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  27.47 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  27.78 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  27.78 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  28.81 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0323  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00135307  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  28.1 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  29.75 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  31.85 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  31.85 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  31.85 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  31.85 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  31.85 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  29.94 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  29.94 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  29.94 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  29.94 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  29.94 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  29.94 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  29.94 
 
 		 207 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  29.94 
 
 		 207 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  30.07 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  27.04 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  25.96 
 
 		 223 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 228 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  27.85 
 
 		 227 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  27.72 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1501  hypothetical protein  27.17 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  26.45 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  25.53 
 
 		 223 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  28.19 
 
 		 226 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  26 
 
 		 223 aa  49.7  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0322  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000024467  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  24.68 
 
 		 223 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0666  curli production assembly/transport component CsgG  22.3 
 
 		 490 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  27.05 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  26.76 
 
 		 227 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2475  hypothetical protein  31.11 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000341463  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0418  hypothetical protein  22.71 
 
 		 551 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  27.45 
 
 		 226 aa  46.2  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  24.22 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  30.77 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000421511  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  25.33 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0651  hypothetical protein  34.72 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  37.04 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2732  putative curli production assembly/transport component csgg precursor  27.89 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01506  putative transport protein for curli synthesis  26.36 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  37.04 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3403  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.23 
 
 		 197 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00726225  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1060  hypothetical protein  29.23 
 
 		 197 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3039  hypothetical protein  29.23 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0898  hypothetical protein  29.23 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138757  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3601  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.23 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0935  hypothetical protein  29.23 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000406943  normal  0.0868767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3478  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.23 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0966746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3015  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.23 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0884  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.23 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000370182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  29.23 
 
 		 201 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5699  hypothetical protein  23.87 
 
 		 447 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.23 
 
 		 197 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  29.23 
 
 		 201 aa  42.7  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4187  hypothetical protein  26.25 
 
 		 574 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>