More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3641 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
200 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  49.2 
 
 
186 aa  189  3e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.24065e-08 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 
317 aa  82.4  4e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
193 aa  72  5e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
193 aa  67  2e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  31.91 
 
 
219 aa  63.2  2e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 
197 aa  61.6  7e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
205 aa  61.2  9e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.83166e-05 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  23.27 
 
 
202 aa  61.2  9e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
241 aa  60.8  1e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
193 aa  60.8  1e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 
196 aa  60.5  2e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  26.97 
 
 
200 aa  60.1  2e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
193 aa  59.7  2e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 
209 aa  59.7  3e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 
197 aa  59.7  3e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 
218 aa  58.9  5e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
206 aa  58.9  5e-08  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
193 aa  58.2  8e-08  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 
185 aa  58.2  9e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 
206 aa  57.8  1e-07  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 
201 aa  57.8  1e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  31.46 
 
 
199 aa  57.8  1e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 
204 aa  57.4  2e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 
209 aa  56.6  2e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
209 aa  57  2e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
198 aa  56.2  3e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
202 aa  56.2  3e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 
72 aa  55.8  4e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
211 aa  55.8  4e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 
211 aa  55.8  4e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
211 aa  55.8  4e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
211 aa  55.8  4e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
211 aa  55.8  4e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
194 aa  55.8  4e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
228 aa  55.8  4e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
211 aa  55.8  4e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
324 aa  55.5  5e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 
225 aa  55.5  6e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 
211 aa  55.1  6e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
226 aa  55.1  6e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 
205 aa  55.5  6e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
210 aa  54.3  1e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
195 aa  54.3  1e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  48.98 
 
 
251 aa  54.3  1e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
221 aa  54.3  1e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
195 aa  54.3  1e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
192 aa  53.9  1e-06  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
203 aa  54.3  1e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 
212 aa  53.9  1e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
231 aa  54.3  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 
226 aa  54.3  1e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
218 aa  53.9  2e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
197 aa  53.9  2e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
187 aa  53.5  2e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 
214 aa  53.5  2e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
205 aa  53.5  2e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
226 aa  53.5  2e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
291 aa  53.5  2e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
232 aa  53.5  2e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  24.6 
 
 
211 aa  53.1  2e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  31.65 
 
 
206 aa  53.9  2e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 
208 aa  53.9  2e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 
225 aa  53.9  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
196 aa  53.9  2e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
198 aa  53.5  2e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 
200 aa  53.9  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 
206 aa  53.1  3e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
295 aa  52.8  3e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 
205 aa  52.8  3e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
207 aa  52.8  3e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
222 aa  52.4  4e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
221 aa  52.8  4e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  52.4  4e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
220 aa  52.4  4e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
204 aa  52.8  4e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
201 aa  52.4  4e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
199 aa  52.4  4e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  32.39 
 
 
206 aa  52.4  4e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  34.57 
 
 
203 aa  52.4  4e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  32.58 
 
 
230 aa  52.8  4e-06  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
195 aa  52.4  5e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  7.22764e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
224 aa  52.4  5e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
211 aa  52  5e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
243 aa  52.4  5e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  37.7 
 
 
198 aa  52  5e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
187 aa  52.4  5e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 
203 aa  52.4  5e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 
202 aa  52  6e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 
208 aa  52  6e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 
201 aa  52  6e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
208 aa  52  6e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  31.52 
 
 
210 aa  52  6e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
205 aa  52  6e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 
225 aa  52  6e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
215 aa  52  6e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
208 aa  51.6  7e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 
194 aa  51.6  7e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 
199 aa  51.6  7e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
201 aa  52  7e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.747573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>