56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3546 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  625  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  66.78 
 
 
301 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  47.35 
 
 
298 aa  281  9e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  50.73 
 
 
320 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  47.16 
 
 
301 aa  275  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  49.27 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  47.35 
 
 
285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  47.35 
 
 
285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  48.36 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  47.35 
 
 
308 aa  270  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  45.45 
 
 
304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  35.87 
 
 
275 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
278 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  31.43 
 
 
284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  33.58 
 
 
603 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  35.25 
 
 
282 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  30.29 
 
 
276 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  29.97 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  33.99 
 
 
607 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  29.93 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 
276 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  28.47 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  30.03 
 
 
333 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 
301 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
322 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
283 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 
323 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  28.32 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 
313 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 
289 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 
301 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  28.31 
 
 
349 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 
308 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 
284 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  28.62 
 
 
320 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  27.01 
 
 
279 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  28.47 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  28.14 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  25.09 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 
287 aa  85.5  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.1 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.18 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  25.5 
 
 
248 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  24.29 
 
 
259 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  24.6 
 
 
243 aa  52.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  23.94 
 
 
251 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 
246 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  20.95 
 
 
250 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  31.19 
 
 
393 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  24.09 
 
 
375 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>