More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3452 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 490 aa  976    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.3 
 
 		 487 aa  465  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 		 478 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0493161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0633  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 		 478 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.53 
 
 		 477 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  35.13 
 
 		 459 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  36.71 
 
 		 469 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.9 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  35.99 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 475 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.31 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  29.62 
 
 		 461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  33.03 
 
 		 583 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 458 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  36.61 
 
 		 431 aa  160  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 473 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.88 
 
 		 466 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  31.23 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  31.23 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  31.23 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 504 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  31.37 
 
 		 470 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 480 aa  157  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  32.35 
 
 		 463 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 465 aa  156  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  30.91 
 
 		 482 aa  156  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  30.91 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  33.89 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  32.06 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  30.91 
 
 		 480 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.3 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  30.74 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 462 aa  153  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  29.57 
 
 		 592 aa  152  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  32.66 
 
 		 436 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.01 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  33.92 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 436 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 477 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  33.08 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  32.98 
 
 		 457 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  32.98 
 
 		 457 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 467 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  31.42 
 
 		 467 aa  150  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  31.11 
 
 		 436 aa  150  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 469 aa  150  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 459 aa  149  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  28.7 
 
 		 497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  30.03 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  33.21 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  33.21 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  33.21 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  33.21 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  33.21 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  28.66 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  33.21 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  33.06 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  31.51 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  31.35 
 
 		 491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 467 aa  148  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 524 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  31.11 
 
 		 463 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 500 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 466 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  33.21 
 
 		 715 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  29.51 
 
 		 386 aa  147  6e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  32.06 
 
 		 462 aa  147  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1092  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 464 aa  146  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 358 aa  146  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1616  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 587 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 478 aa  146  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  31.02 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  31.02 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 513 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>