81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3332 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  81.43 
 
 
477 aa  736    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  100 
 
 
481 aa  949    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  57.76 
 
 
478 aa  533  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  57.56 
 
 
488 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  55.14 
 
 
472 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  52.17 
 
 
487 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  52.17 
 
 
487 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  48.14 
 
 
483 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  37.31 
 
 
472 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  30.45 
 
 
433 aa  210  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  33.71 
 
 
434 aa  206  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  31.95 
 
 
459 aa  203  5e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  31.32 
 
 
433 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  32.35 
 
 
434 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  29.87 
 
 
449 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  28.67 
 
 
432 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  29.42 
 
 
457 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  30.59 
 
 
452 aa  178  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  29.42 
 
 
457 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  29.13 
 
 
450 aa  169  9e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  29.74 
 
 
448 aa  168  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  26.22 
 
 
448 aa  167  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  30.05 
 
 
474 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  28.78 
 
 
452 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  29.72 
 
 
448 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  29.48 
 
 
474 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  27.92 
 
 
449 aa  159  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  28.08 
 
 
449 aa  157  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0707  hypothetical protein  30.62 
 
 
463 aa  149  9e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  29.57 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  29.55 
 
 
447 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  29.37 
 
 
472 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  28.23 
 
 
438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  27.56 
 
 
481 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  28.78 
 
 
467 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  24.94 
 
 
478 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  29.13 
 
 
452 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  25.61 
 
 
480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  25.12 
 
 
473 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  31.26 
 
 
427 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  27.95 
 
 
479 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  31.11 
 
 
427 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  27.95 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  24.88 
 
 
473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  29.98 
 
 
433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  26.64 
 
 
459 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  26.93 
 
 
475 aa  118  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  26.38 
 
 
444 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  24.82 
 
 
475 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  25.06 
 
 
475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  24.18 
 
 
475 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  24.59 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  26.18 
 
 
465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  26.02 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  29.98 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  29.67 
 
 
417 aa  110  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  25.29 
 
 
484 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  24.82 
 
 
477 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  27.75 
 
 
449 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  28.47 
 
 
476 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  26.53 
 
 
459 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  26.53 
 
 
459 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  24.64 
 
 
477 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  27.63 
 
 
478 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  24.87 
 
 
476 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  26.13 
 
 
477 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  26.36 
 
 
477 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  24.28 
 
 
477 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  28.14 
 
 
455 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  26.02 
 
 
481 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  24.94 
 
 
475 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.085296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  26.98 
 
 
512 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  25.51 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  28.05 
 
 
459 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  24.17 
 
 
481 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  26.4 
 
 
455 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  28.26 
 
 
458 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  26.58 
 
 
447 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3713  PUCC protein  26.44 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368833  hitchhiker  0.000507532 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  23.34 
 
 
401 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
457 aa  43.1  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>