113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3208 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3208  permease  100 
 
 
350 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  79.55 
 
 
350 aa  532  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  64.66 
 
 
336 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  61.71 
 
 
362 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  60.17 
 
 
343 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  60.17 
 
 
343 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  59.13 
 
 
341 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  55.14 
 
 
335 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  40.73 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  39.16 
 
 
328 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  39.16 
 
 
328 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  33.53 
 
 
298 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  36.86 
 
 
318 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  35.83 
 
 
346 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  36 
 
 
318 aa  166  8e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  36.21 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  30.54 
 
 
300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  34.38 
 
 
312 aa  162  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  29.29 
 
 
297 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  34.28 
 
 
524 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  29.59 
 
 
297 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  29.19 
 
 
324 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  31.96 
 
 
358 aa  155  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  33.44 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  33.44 
 
 
298 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  27.38 
 
 
371 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  33.13 
 
 
298 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  33.13 
 
 
298 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  33.13 
 
 
298 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  33.13 
 
 
298 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  33.13 
 
 
298 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  33.13 
 
 
298 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  33.13 
 
 
298 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  33.44 
 
 
298 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  29.01 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  29.05 
 
 
324 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  29.6 
 
 
524 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  29.91 
 
 
325 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  29.91 
 
 
325 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  30.32 
 
 
288 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  28.13 
 
 
325 aa  143  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  30.86 
 
 
288 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  29.22 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  28.88 
 
 
342 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  28.96 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  31.68 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  31.99 
 
 
343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  29.59 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  25.15 
 
 
364 aa  110  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  31.53 
 
 
357 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  40.94 
 
 
332 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  47 
 
 
365 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  30.41 
 
 
350 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  41.67 
 
 
352 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  24.32 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  24.93 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  23.53 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  25.49 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  21.63 
 
 
451 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  21.97 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  20.9 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  23.46 
 
 
633 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  39.77 
 
 
620 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  21.67 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  19.83 
 
 
423 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  20.3 
 
 
363 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  20.11 
 
 
433 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  33.01 
 
 
342 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  24.79 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  24 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  20.2 
 
 
461 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  31.25 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  21.43 
 
 
475 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  31.07 
 
 
300 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  22.22 
 
 
611 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  22.26 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  22.85 
 
 
366 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  23.53 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  28.1 
 
 
378 aa  50.1  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  29.36 
 
 
293 aa  50.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  23.51 
 
 
391 aa  49.7  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  26.56 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  26.52 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  26.32 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  26.44 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  26.32 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  31.58 
 
 
317 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  20 
 
 
367 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  32.14 
 
 
335 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  26.22 
 
 
323 aa  46.2  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  26.22 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  27.21 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  27.5 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  29.27 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  21.85 
 
 
474 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  25.96 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  27.5 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  23.72 
 
 
315 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  28.05 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  32.14 
 
 
331 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>