175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3203 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  609  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  48.04 
 
 
312 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  49.83 
 
 
320 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  49.83 
 
 
320 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  45.82 
 
 
314 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  46.32 
 
 
313 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  45.58 
 
 
317 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  45.58 
 
 
317 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  37.59 
 
 
584 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  37.98 
 
 
850 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  37.98 
 
 
850 aa  189  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  37.63 
 
 
850 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  40.98 
 
 
516 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  33.79 
 
 
317 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  34.85 
 
 
517 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  34.87 
 
 
881 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  33.45 
 
 
692 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  36.01 
 
 
850 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  36.01 
 
 
850 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  35.66 
 
 
850 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  35.66 
 
 
850 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  35.86 
 
 
896 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0811  hypothetical protein  34.7 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00494476  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  32.68 
 
 
872 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  34.69 
 
 
362 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  37.09 
 
 
864 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  37.36 
 
 
844 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  32.63 
 
 
866 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  32.49 
 
 
356 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  32.03 
 
 
313 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0842  hypothetical protein  33.71 
 
 
318 aa  143  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3502  hypothetical protein  32.46 
 
 
332 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2854  conserved hypothetical protein  33.71 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.552583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0936  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5038  hypothetical protein  32.7 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00557373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2855  hypothetical protein  33.71 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00195846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  31.17 
 
 
875 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  32.85 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00755  conserved inner membrane protein  31.74 
 
 
318 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00772  hypothetical protein  31.74 
 
 
318 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0852  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.9195  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  31.67 
 
 
320 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2564  hypothetical protein  32.95 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  33.58 
 
 
844 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  34.95 
 
 
867 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  32.44 
 
 
351 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  35.02 
 
 
867 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  33.11 
 
 
869 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  32.03 
 
 
855 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  33.11 
 
 
343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  33.11 
 
 
343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2527  hypothetical protein  31.67 
 
 
340 aa  135  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  28.42 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  32.16 
 
 
739 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0046  hypothetical protein  32.63 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000145841  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2647  hypothetical protein  31.72 
 
 
319 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0846  inner membrane protein YbhN  35.45 
 
 
320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0906  inner membrane protein YbhN  35.07 
 
 
320 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.409444  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0938  hypothetical protein  35.07 
 
 
320 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0874  inner membrane protein YbhN  35.07 
 
 
320 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0959  inner membrane protein YbhN  35.07 
 
 
320 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.262362  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  30.93 
 
 
870 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  28.39 
 
 
864 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3276  hypothetical protein  30.65 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0014369  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  29.87 
 
 
393 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_004310  BR1326  hypothetical protein  32.47 
 
 
323 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0756849  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1286  hypothetical protein  32.47 
 
 
323 aa  129  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  32.03 
 
 
320 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  31.72 
 
 
854 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  33.85 
 
 
850 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1279  hypothetical protein  33.46 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.408469  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09860  membrane protein  31.23 
 
 
316 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2633  hypothetical protein  30.97 
 
 
317 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3617  hypothetical protein  30.34 
 
 
350 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0024  hypothetical protein  28.87 
 
 
338 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0012  hypothetical protein  31.14 
 
 
340 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0484  hypothetical protein  30.48 
 
 
331 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  28.21 
 
 
864 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  29.11 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  29.93 
 
 
877 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  30.48 
 
 
863 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  30.48 
 
 
863 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3263  hypothetical protein  30.6 
 
 
317 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0011  hypothetical protein  32.01 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2497  hypothetical protein  30.6 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4608  hypothetical protein  28.47 
 
 
321 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1858  hypothetical protein  30.74 
 
 
315 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0717922  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0743  hypothetical protein  29.45 
 
 
350 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  28.21 
 
 
889 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  28.21 
 
 
889 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  28.21 
 
 
889 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0879  hypothetical protein  28.47 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00199978  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  29.93 
 
 
864 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3384  hypothetical protein  31.58 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0901  hypothetical protein  28.36 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3951  hypothetical protein  30.34 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0277158  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  27.5 
 
 
864 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  32.27 
 
 
877 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  27.86 
 
 
864 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  32.27 
 
 
877 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>