More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3088 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 282 aa  584  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  83.87 
 
 		 279 aa  497  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  73.29 
 
 		 281 aa  431  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  74.37 
 
 		 278 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  73.65 
 
 		 281 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  72.92 
 
 		 281 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  73.21 
 
 		 280 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  68.1 
 
 		 280 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  60.76 
 
 		 407 aa  357  9e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  57.09 
 
 		 334 aa  314  9e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  53.55 
 
 		 280 aa  296  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  52.98 
 
 		 284 aa  292  5e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  54.8 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  52.65 
 
 		 283 aa  280  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  51.6 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  50.91 
 
 		 274 aa  279  4e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  50.53 
 
 		 277 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  50.35 
 
 		 292 aa  276  3e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  53.02 
 
 		 284 aa  271  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  49.82 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  49.82 
 
 		 277 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  48.39 
 
 		 277 aa  268  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  51.25 
 
 		 323 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  49.29 
 
 		 355 aa  266  2e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  49.11 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  47 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  48.59 
 
 		 278 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  47.16 
 
 		 282 aa  255  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  48.75 
 
 		 278 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  46.5 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  46.83 
 
 		 278 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  46.95 
 
 		 286 aa  251  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  46.48 
 
 		 278 aa  251  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  48.93 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  46.48 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  45.91 
 
 		 284 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  47.16 
 
 		 278 aa  249  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  45.16 
 
 		 278 aa  245  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  44.64 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  44.17 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  44.17 
 
 		 284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  45.94 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  45.2 
 
 		 277 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  46.04 
 
 		 308 aa  238  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  45.91 
 
 		 277 aa  238  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  49.11 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  47.14 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  43.17 
 
 		 278 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  46.79 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  44.52 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  42.51 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  43.6 
 
 		 292 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  43.25 
 
 		 315 aa  232  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5289  diaminopimelate epimerase  47.14 
 
 		 276 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  43.42 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  48.21 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  43.77 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0244  diaminopimelate epimerase  46.79 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0867905  normal  0.652879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0224  diaminopimelate epimerase  47.5 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  41.81 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  44.17 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  43.93 
 
 		 277 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5137  diaminopimelate epimerase  46.43 
 
 		 276 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.91439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  42.16 
 
 		 309 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  42.16 
 
 		 309 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  43.9 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  43.51 
 
 		 289 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  42.52 
 
 		 292 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  41.81 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  43.66 
 
 		 288 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  41.81 
 
 		 309 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  43.51 
 
 		 289 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  43.01 
 
 		 279 aa  224  9e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  43.16 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  41.07 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  43.16 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  43.16 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  43.16 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  43.16 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3739  diaminopimelate epimerase  46.24 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  42.66 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  42.45 
 
 		 275 aa  222  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  42.29 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 275 aa  222  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  42.01 
 
 		 291 aa  221  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  41.73 
 
 		 275 aa  221  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  41.79 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  41.11 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  41.22 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0183  diaminopimelate epimerase  46.43 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5499  diaminopimelate epimerase  45.71 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  41.61 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  42.05 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>