21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2933 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2933  CpcD phycobilisome linker-like  100 
 
 		 80 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3486  CpcD phycobilisome linker domain-containing protein  84.81 
 
 		 81 aa  110  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.324209  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0157  CpcD phycobilisome linker domain protein  59.49 
 
 		 79 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00508163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3078  CpcD phycobilisome linker domain protein  66.67 
 
 		 78 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  69.7 
 
 		 440 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  0.0000000785266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3042  CpcD phycobilisome linker domain protein  66.67 
 
 		 78 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1693  CpcD phycobilisome linker domain protein  67.69 
 
 		 76 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.268965 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  57.53 
 
 		 439 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1051  phycocyanin linker protein 9K  53.25 
 
 		 81 aa  84.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  61.54 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2543  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  60 
 
 		 406 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3563  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  60 
 
 		 406 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5201  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  53.73 
 
 		 403 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86768e-21 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  51.39 
 
 		 403 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000202848  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  52.17 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0564  hypothetical protein  48.33 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0581  hypothetical protein  48.33 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  39.68 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  38.67 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  36.51 
 
 		 286 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1761  hypothetical protein  39.71 
 
 		 143 aa  40.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.381589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>