43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2917 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2917  thymidylate synthase complementing protein ThyX  100 
 
 
240 aa  504  1e-142  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  3.86154e-05  normal  0.0185293 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1044  thymidylate synthase complementing protein ThyX  69.58 
 
 
240 aa  374  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0273  thymidylate synthase complementing protein ThyX  66.67 
 
 
251 aa  348  5e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2071  thymidylate synthase complementing protein ThyX  64.29 
 
 
241 aa  335  3e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2082  thymidylate synthase, flavin-dependent  71.05 
 
 
458 aa  238  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.734062  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2080  thymidylate synthase complementing protein ThyX  69.23 
 
 
73 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.02 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  28.76 
 
 
245 aa  68.9  6e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  29.69 
 
 
243 aa  68.2  1e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  28.57 
 
 
248 aa  64.3  1e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.6 
 
 
223 aa  60.8  2e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  28 
 
 
246 aa  59.3  5e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  28.9 
 
 
261 aa  58.2  1e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  28 
 
 
245 aa  58.5  1e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  26.89 
 
 
226 aa  58.2  1e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  30.5 
 
 
228 aa  56.6  4e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  24.22 
 
 
245 aa  54.7  1e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  3.29367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.92 
 
 
273 aa  53.9  2e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.92 
 
 
273 aa  53.9  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  27.92 
 
 
282 aa  53.5  3e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  26.34 
 
 
243 aa  52  9e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  24.55 
 
 
232 aa  52  9e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  25.23 
 
 
228 aa  51.6  1e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.28347e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1187  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.25 
 
 
273 aa  51.2  2e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.933104 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.47 
 
 
226 aa  51.2  2e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  3.4032e-05 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.56 
 
 
218 aa  51.2  2e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.53 
 
 
281 aa  50.1  3e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2792  FAD-dependent thymidylate synthase  24.86 
 
 
285 aa  49.3  5e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  23.32 
 
 
230 aa  48.9  6e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  24.89 
 
 
245 aa  48.5  9e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  24.67 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.06523e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  21.43 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  3.90103e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  24.89 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.71 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  26.57 
 
 
325 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  27.17 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.3 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21907e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  34.33 
 
 
284 aa  44.7  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  25 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  28.44 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.28 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.07587e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.43 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  32.84 
 
 
253 aa  42.7  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>