63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2916 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  100 
 
 
72 aa  145  1e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  1.94255e-05  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  70.42 
 
 
71 aa  109  1e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  63.38 
 
 
94 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  60.56 
 
 
70 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  52.86 
 
 
72 aa  65.9  2e-10  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  55.32 
 
 
59 aa  55.8  2e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0824  high light inducible protein  43.06 
 
 
83 aa  55.8  2e-07  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1831  high light inducible protein  43.06 
 
 
83 aa  55.1  3e-07  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  60 
 
 
59 aa  53.9  7e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08761  high light inducible protein  39.39 
 
 
67 aa  53.5  1e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  56.1 
 
 
47 aa  49.7  1e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  58.54 
 
 
47 aa  49.7  1e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  54.55 
 
 
47 aa  49.3  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15711  high light inducible protein  36.76 
 
 
68 aa  48.9  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  66.67 
 
 
55 aa  48.9  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  53.19 
 
 
50 aa  48.9  3e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  48 
 
 
67 aa  48.1  4e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04211  high light inducible protein  40 
 
 
69 aa  47.8  5e-05  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  48.94 
 
 
59 aa  47.8  6e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1510  high light inducible protein-like  37.7 
 
 
69 aa  47.4  7e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.513618  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  45.1 
 
 
66 aa  47.4  7e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  57.89 
 
 
56 aa  47  8e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15981  high light inducible protein  33.82 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13041  high light inducible protein  35.29 
 
 
68 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13181  hypothetical protein  35.29 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.655932  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15821  high light inducible protein-like protein  33.82 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  48.94 
 
 
50 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1228  high light inducible protein-like  35.29 
 
 
68 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12921  high light inducible protein  35.29 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.872444  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04401  putative high light inducible protein  42.55 
 
 
50 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  48.94 
 
 
50 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  56.1 
 
 
47 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  56.1 
 
 
47 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  48.94 
 
 
50 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  50 
 
 
46 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  61.11 
 
 
48 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2064  hypothetical protein  44.68 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0330706  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  44.9 
 
 
56 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1481  high light inducible protein-like  35.29 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  48.94 
 
 
50 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  63.33 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08911  hypothetical protein  37.7 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17481  high light inducible protein  37.7 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.598336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  52.5 
 
 
388 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  42.86 
 
 
56 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15161  high light inducible protein  39.73 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.163919  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  50 
 
 
58 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  5.95991e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  50 
 
 
58 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  46.81 
 
 
387 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1414  high light inducible protein-like  48 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.680759  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15031  high light inducible protein  48 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  42.55 
 
 
50 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  45.71 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  42.55 
 
 
50 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  45.71 
 
 
91 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  37.5 
 
 
59 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  44.68 
 
 
50 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  46.94 
 
 
54 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  3.10202e-05 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00761  high light inducible protein  40.54 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  47.22 
 
 
58 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  54.29 
 
 
46 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  33.33 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  42.86 
 
 
69 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>