More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2902 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  48.6 
 
 
908 aa  828  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  52.76 
 
 
927 aa  877  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  54.24 
 
 
924 aa  860  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  50.57 
 
 
967 aa  913  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  52.53 
 
 
927 aa  873  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  48.04 
 
 
908 aa  821  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  62.44 
 
 
905 aa  1107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 
893 aa  1832  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  2.84094e-07 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  48.77 
 
 
908 aa  811  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  61.2 
 
 
889 aa  1077  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  52.98 
 
 
924 aa  859  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  49.16 
 
 
1003 aa  918  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  48.65 
 
 
908 aa  830  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  58.81 
 
 
919 aa  1050  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  54.35 
 
 
926 aa  869  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  50.67 
 
 
967 aa  912  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  52.5 
 
 
924 aa  888  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  79.84 
 
 
890 aa  1400  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  38.97 
 
 
1055 aa  594  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  34.26 
 
 
904 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.44 
 
 
984 aa  436  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.27696e-07 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  33.73 
 
 
916 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.29 
 
 
947 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.35 
 
 
952 aa  416  1e-115  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.09 
 
 
950 aa  416  1e-115  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.87 
 
 
964 aa  415  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  33.66 
 
 
972 aa  407  1e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  34.46 
 
 
918 aa  406  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  31.64 
 
 
953 aa  402  1e-110  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  32.25 
 
 
936 aa  399  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  35.13 
 
 
906 aa  399  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.37 
 
 
918 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.11 
 
 
917 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.48 
 
 
918 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.48 
 
 
918 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  32.37 
 
 
909 aa  393  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.59 
 
 
951 aa  393  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.87 
 
 
922 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.24 
 
 
950 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.72 
 
 
929 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.82 
 
 
921 aa  385  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  32.56 
 
 
935 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.63 
 
 
981 aa  383  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.05 
 
 
996 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.23 
 
 
932 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.06 
 
 
931 aa  378  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.96 
 
 
951 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.51 
 
 
919 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  1.93784e-06 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  41.67 
 
 
906 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  32.85 
 
 
952 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.65 
 
 
933 aa  363  8e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  29.59 
 
 
1068 aa  360  5e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  38.6 
 
 
877 aa  360  8e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  39.22 
 
 
863 aa  356  1e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  31.19 
 
 
994 aa  355  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  42.14 
 
 
940 aa  347  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  1.4502e-06  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  30.56 
 
 
1073 aa  340  9e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.29 
 
 
815 aa  334  4e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  29.77 
 
 
1023 aa  333  1e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.08 
 
 
762 aa  328  2e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  29.89 
 
 
998 aa  317  6e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  37.69 
 
 
933 aa  314  6e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.65 
 
 
843 aa  308  4e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  36.31 
 
 
1068 aa  307  5e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.31 
 
 
709 aa  294  6e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  38.44 
 
 
872 aa  293  7e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  36.12 
 
 
1239 aa  288  3e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  35.61 
 
 
1175 aa  277  5e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.73 
 
 
817 aa  231  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  30.6 
 
 
961 aa  230  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.37 
 
 
990 aa  225  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  53.33 
 
 
1026 aa  221  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.54 
 
 
848 aa  218  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  38.11 
 
 
853 aa  214  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.58 
 
 
847 aa  214  8e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59674e-11 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.58 
 
 
868 aa  213  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.37 
 
 
861 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.37 
 
 
861 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  33.04 
 
 
842 aa  209  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.69 
 
 
845 aa  209  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.82 
 
 
710 aa  209  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.46 
 
 
861 aa  208  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  32.58 
 
 
861 aa  207  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.88 
 
 
876 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.6 
 
 
838 aa  205  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.87 
 
 
837 aa  204  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.77 
 
 
847 aa  204  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.73 
 
 
950 aa  203  1e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  32.24 
 
 
869 aa  202  2e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.75 
 
 
894 aa  200  1e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.39 
 
 
827 aa  199  2e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  31.14 
 
 
891 aa  198  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.61 
 
 
852 aa  198  4e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.61 
 
 
852 aa  198  4e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.61 
 
 
852 aa  198  4e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.99 
 
 
1231 aa  197  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.91 
 
 
831 aa  195  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  36.5 
 
 
855 aa  195  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.84 
 
 
853 aa  194  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  32.77 
 
 
860 aa  194  5e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>