More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2899 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  457  1e-128  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  4.14809e-05  unclonable  1.49465e-07 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  76.13 
 
 
222 aa  349  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  1.80777e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  66.06 
 
 
226 aa  320  2e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  63.47 
 
 
224 aa  290  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  63.89 
 
 
224 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  61.93 
 
 
219 aa  289  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  58.74 
 
 
228 aa  251  5e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  53.85 
 
 
221 aa  234  5e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  40.27 
 
 
213 aa  174  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  39.82 
 
 
213 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  39.81 
 
 
212 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  41.7 
 
 
227 aa  168  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  40.43 
 
 
231 aa  165  6e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  42.86 
 
 
231 aa  164  7e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  43.07 
 
 
213 aa  164  1e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  46.19 
 
 
228 aa  162  4e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  42.49 
 
 
234 aa  161  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  42.48 
 
 
232 aa  161  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  41.2 
 
 
231 aa  161  8e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  42.47 
 
 
225 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  38.05 
 
 
253 aa  161  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.27174e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  44.71 
 
 
235 aa  160  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  45.71 
 
 
228 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  37.26 
 
 
211 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  44.76 
 
 
228 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  41.67 
 
 
237 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  40.72 
 
 
220 aa  157  9e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  45.45 
 
 
228 aa  157  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  43.35 
 
 
235 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  43.96 
 
 
227 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 
230 aa  156  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  43 
 
 
199 aa  156  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  41.96 
 
 
228 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  36.49 
 
 
211 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  42.93 
 
 
234 aa  155  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  40.91 
 
 
219 aa  155  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  41.28 
 
 
227 aa  155  5e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  45.1 
 
 
230 aa  155  5e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  40.45 
 
 
231 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.33107e-10 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  40.83 
 
 
223 aa  154  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  44.88 
 
 
229 aa  155  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  39.46 
 
 
230 aa  154  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  37.44 
 
 
234 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  8.22407e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  43.81 
 
 
228 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  41.15 
 
 
228 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  41.96 
 
 
230 aa  152  3e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  41.15 
 
 
232 aa  152  3e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  41.96 
 
 
231 aa  152  3e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  36.76 
 
 
235 aa  152  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  5.05441e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  41.38 
 
 
235 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  38.6 
 
 
226 aa  151  6e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  35.48 
 
 
219 aa  151  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.8196e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  35.87 
 
 
233 aa  151  9e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.74178e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  39.73 
 
 
244 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  40.85 
 
 
240 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  3.41691e-10 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  35.94 
 
 
219 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  1.09011e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  39.45 
 
 
223 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  38.18 
 
 
244 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  39.32 
 
 
276 aa  148  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  41.71 
 
 
238 aa  148  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  39.51 
 
 
239 aa  148  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  40 
 
 
241 aa  148  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  41.71 
 
 
229 aa  148  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  38.42 
 
 
225 aa  147  1e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  7.65684e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  36.36 
 
 
190 aa  147  1e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  41.15 
 
 
232 aa  147  1e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  39.15 
 
 
236 aa  147  1e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  41.35 
 
 
232 aa  147  1e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  41.18 
 
 
242 aa  147  2e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  40.87 
 
 
232 aa  146  2e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  38.53 
 
 
216 aa  147  2e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  38.91 
 
 
224 aa  147  2e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  40.76 
 
 
238 aa  146  2e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  39.32 
 
 
239 aa  146  2e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  3.12862e-07 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  39.15 
 
 
233 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  38.64 
 
 
248 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  38.05 
 
 
237 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.28212e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  39.72 
 
 
238 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  41.95 
 
 
233 aa  145  4e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  43.11 
 
 
229 aa  145  4e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  36.4 
 
 
228 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  40.89 
 
 
244 aa  145  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  38.12 
 
 
235 aa  145  7e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  38.69 
 
 
225 aa  144  8e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  3.58691e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  42.01 
 
 
220 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  40.38 
 
 
232 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.13695e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  37.98 
 
 
236 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  37.22 
 
 
224 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  41.81 
 
 
230 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  36.95 
 
 
231 aa  143  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  36.04 
 
 
219 aa  143  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  42.06 
 
 
232 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  39.61 
 
 
213 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  41.59 
 
 
257 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  42.52 
 
 
268 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  38.24 
 
 
232 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  41.33 
 
 
226 aa  142  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  37.73 
 
 
219 aa  142  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  38.05 
 
 
280 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  41.75 
 
 
237 aa  142  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>