More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2858 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  100 
 
 		 517 aa  1028    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.95 
 
 		 504 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  43.58 
 
 		 489 aa  330  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  39.5 
 
 		 500 aa  311  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.01 
 
 		 487 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.01 
 
 		 487 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.08 
 
 		 490 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.5 
 
 		 432 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  40.29 
 
 		 450 aa  256  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.63 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.63 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  30.23 
 
 		 388 aa  158  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  32.03 
 
 		 509 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  35.42 
 
 		 357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  38.14 
 
 		 357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.52 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.11 
 
 		 467 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  33.18 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.05 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  34.06 
 
 		 392 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  31.16 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  30.7 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  33.73 
 
 		 395 aa  131  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  30.23 
 
 		 353 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  35.16 
 
 		 417 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  30.23 
 
 		 353 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.53 
 
 		 329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.71 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  28.49 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.09 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.59 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.82 
 
 		 516 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.82 
 
 		 516 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  30.66 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 		 432 aa  116  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  33.23 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  28.79 
 
 		 345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  26.48 
 
 		 424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.68 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  31.46 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  30.5 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  28.09 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  25.4 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  24.5 
 
 		 634 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  28.4 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  24.95 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  29.14 
 
 		 414 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 489 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.17 
 
 		 404 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  30.25 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  30 
 
 		 337 aa  107  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  28.53 
 
 		 344 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.28 
 
 		 415 aa  106  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  25.5 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  25.89 
 
 		 359 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  25.11 
 
 		 403 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  30.47 
 
 		 335 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1596  secretion protein HlyD family protein  26.91 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  29.3 
 
 		 641 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.7 
 
 		 481 aa  103  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  29.04 
 
 		 398 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  24.77 
 
 		 449 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.29 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.37 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  29.36 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  29.62 
 
 		 347 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  29.41 
 
 		 344 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  26.96 
 
 		 333 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.66 
 
 		 608 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  24.06 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  25.15 
 
 		 444 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  25.57 
 
 		 331 aa  100  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  27.75 
 
 		 328 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  27.75 
 
 		 328 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.21 
 
 		 428 aa  100  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  28.81 
 
 		 398 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.6 
 
 		 453 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  23.52 
 
 		 465 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  27.2 
 
 		 328 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.99 
 
 		 465 aa  99  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  27.43 
 
 		 631 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  26.01 
 
 		 431 aa  99  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  29.71 
 
 		 348 aa  99.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1836  hypothetical protein  28.77 
 
 		 865 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1862  hypothetical protein  28.77 
 
 		 865 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  26.65 
 
 		 353 aa  98.6  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  27.25 
 
 		 375 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3158  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 		 463 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.41 
 
 		 430 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1575  RND membrane fusion protein AcrA  24.77 
 
 		 448 aa  97.4  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853878 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  27.79 
 
 		 424 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 405 aa  97.8  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  29.57 
 
 		 333 aa  97.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  27.75 
 
 		 366 aa  97.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  30.05 
 
 		 434 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2960  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 463 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.401825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>