More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2840 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
849 aa  1708  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  6.8938e-06  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  49.01 
 
 
738 aa  613  1e-174  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  39.75 
 
 
813 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  9.03307e-07 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  39.78 
 
 
816 aa  509  1e-142  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 
839 aa  506  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  40.75 
 
 
843 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  39.75 
 
 
812 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  38.04 
 
 
709 aa  452  1e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  4.70025e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  39.77 
 
 
697 aa  438  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  2.91802e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  34.65 
 
 
771 aa  347  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  33.8 
 
 
704 aa  333  7e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  1.8886e-07  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  32.06 
 
 
717 aa  328  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 
751 aa  326  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 
783 aa  322  1e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  31.57 
 
 
755 aa  321  3e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 
758 aa  314  4e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 
716 aa  311  3e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 
710 aa  307  4e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 
704 aa  306  8e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 
701 aa  303  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 
700 aa  302  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  32.38 
 
 
721 aa  301  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 
718 aa  300  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 
701 aa  296  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 
817 aa  294  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  7.27933e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  31.2 
 
 
713 aa  288  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  31.92 
 
 
724 aa  288  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  31.06 
 
 
714 aa  284  6e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 
723 aa  283  9e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.84805e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 
725 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.97487e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 
746 aa  282  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 
723 aa  282  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  7.46849e-06  unclonable  2.33468e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 
725 aa  281  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  5.94671e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 
725 aa  281  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  28.91 
 
 
732 aa  280  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 
725 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 
732 aa  276  1e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 
809 aa  272  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 
726 aa  271  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 
726 aa  270  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 
726 aa  270  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 
721 aa  268  3e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  28.63 
 
 
733 aa  268  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 
739 aa  266  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  31.29 
 
 
713 aa  261  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 
723 aa  261  5e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.35146e-05  unclonable  1.54672e-10 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 
723 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  3.8397e-05 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 
716 aa  253  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  29.16 
 
 
745 aa  247  8e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 
808 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  29.35 
 
 
742 aa  246  2e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  28.48 
 
 
745 aa  245  2e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  4.45581e-06  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 
745 aa  246  2e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 
808 aa  246  2e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  28.94 
 
 
764 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 
817 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  27.76 
 
 
723 aa  243  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  27.62 
 
 
723 aa  240  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 
728 aa  221  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 
753 aa  216  1e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 
698 aa  211  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 
850 aa  171  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  37.03 
 
 
864 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  38.27 
 
 
843 aa  166  2e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  40.5 
 
 
859 aa  158  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  34.58 
 
 
332 aa  154  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
862 aa  147  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 
853 aa  143  1e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 
851 aa  137  1e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 
860 aa  133  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  2.75089e-07 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  30.55 
 
 
825 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  30.55 
 
 
825 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 
706 aa  109  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  2.64695e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.75 
 
 
750 aa  107  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 
815 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  24.87 
 
 
715 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 
699 aa  104  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 
817 aa  104  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 
837 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 
784 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  26.74 
 
 
639 aa  100  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 
764 aa  99.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 
806 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.24 
 
 
862 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  34.83 
 
 
634 aa  90.5  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 
664 aa  89.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 
701 aa  89.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 
634 aa  89  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 
678 aa  89  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 
705 aa  88.6  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  24.37 
 
 
764 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  38.6 
 
 
762 aa  88.6  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.03 
 
 
862 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 
688 aa  88.6  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.55 
 
 
859 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 
710 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.72 
 
 
862 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25 
 
 
698 aa  87.4  1e-15  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  31.65 
 
 
617 aa  86.3  2e-15  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 
686 aa  86.3  2e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.4407e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>