285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2825 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  100 
 
 
305 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  75.51 
 
 
306 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  67.79 
 
 
304 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  67.34 
 
 
302 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  67.47 
 
 
294 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  66.2 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  61.38 
 
 
309 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  59.39 
 
 
310 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  59.73 
 
 
310 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  60.27 
 
 
312 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  59.39 
 
 
310 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  58.7 
 
 
310 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  59.73 
 
 
314 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  58 
 
 
317 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  58.72 
 
 
312 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  58.36 
 
 
313 aa  374  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  57.93 
 
 
339 aa  374  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  56.45 
 
 
317 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  58.72 
 
 
312 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  58.05 
 
 
309 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  56.9 
 
 
352 aa  366  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  58.76 
 
 
326 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  57.84 
 
 
332 aa  364  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  56.9 
 
 
352 aa  364  1e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  57.79 
 
 
326 aa  364  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  62.27 
 
 
315 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  57.38 
 
 
309 aa  362  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  57.53 
 
 
330 aa  363  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  57.14 
 
 
326 aa  362  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  58.74 
 
 
314 aa  361  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  57.97 
 
 
319 aa  360  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  55.44 
 
 
337 aa  359  3e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  56.79 
 
 
332 aa  358  5e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  56.51 
 
 
330 aa  358  6e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  56.16 
 
 
334 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  56.16 
 
 
334 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  56.16 
 
 
334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  56.85 
 
 
333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  56.16 
 
 
333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  56.16 
 
 
334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  56.55 
 
 
331 aa  355  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  57.72 
 
 
316 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  56.45 
 
 
326 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  55.75 
 
 
336 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  55.48 
 
 
334 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  56.89 
 
 
323 aa  352  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  56.1 
 
 
326 aa  352  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  57.34 
 
 
322 aa  352  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  54.83 
 
 
341 aa  351  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  54.36 
 
 
328 aa  351  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  56.61 
 
 
316 aa  349  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  55.4 
 
 
327 aa  349  4e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  55.94 
 
 
350 aa  345  8e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  57.45 
 
 
326 aa  343  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  55.59 
 
 
299 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  52.48 
 
 
317 aa  334  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  52.51 
 
 
322 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  53.56 
 
 
305 aa  332  4e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  54.05 
 
 
305 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  54.2 
 
 
305 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  54.05 
 
 
308 aa  329  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  61.26 
 
 
257 aa  327  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  53.79 
 
 
311 aa  326  3e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  55.89 
 
 
313 aa  323  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  51.37 
 
 
301 aa  312  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  53.66 
 
 
312 aa  311  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1635  rhodanese-like protein  51.52 
 
 
327 aa  309  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1395  rhodanese-like protein  49.16 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  53.14 
 
 
555 aa  299  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10921  sulfurtransferase  47.51 
 
 
320 aa  298  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14861  sulfurtransferase  48.45 
 
 
319 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.612505 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0654  rhodanese-like  48.11 
 
 
319 aa  295  5e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.597958  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  59.57 
 
 
255 aa  293  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2196  hypothetical protein  56.2 
 
 
255 aa  292  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  58.9 
 
 
255 aa  291  9e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09971  sulfurtransferase  47.65 
 
 
310 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  53.22 
 
 
254 aa  271  8.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  48.89 
 
 
269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  52.79 
 
 
254 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  47.57 
 
 
275 aa  264  1e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  51.71 
 
 
242 aa  261  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11851  sulfurtransferase  43.43 
 
 
310 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.403922  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0206  rhodanese-like protein  45.9 
 
 
274 aa  250  2e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1105  rhodanese-like protein  42.27 
 
 
310 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12011  sulfurtransferase  42.61 
 
 
310 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.303044  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0896  rhodanese domain-containing protein  46.3 
 
 
275 aa  240  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.259251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  43.82 
 
 
623 aa  236  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12001  sulfurtransferase  42.91 
 
 
310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.982527  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26565  predicted protein  44.26 
 
 
346 aa  232  6e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460392  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0255  rhodanese domain-containing protein  43.54 
 
 
302 aa  226  4e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  43.16 
 
 
287 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  42.46 
 
 
287 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  43.49 
 
 
282 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  43.07 
 
 
282 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  41.76 
 
 
282 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  41.22 
 
 
334 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  41.22 
 
 
284 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0983  rhodanese superfamily protein  41.58 
 
 
333 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0683  rhodanese superfamily protein  45.96 
 
 
248 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.463149  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3293  rhodanese superfamily protein  39.48 
 
 
287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>