More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2654 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  100 
 
 
107 aa  220  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  89.72 
 
 
107 aa  203  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  86.92 
 
 
107 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  84.11 
 
 
107 aa  192  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  81.31 
 
 
107 aa  191  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  81.31 
 
 
107 aa  191  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  84.11 
 
 
107 aa  191  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  82.24 
 
 
148 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  81.31 
 
 
107 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  81.31 
 
 
107 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  81.31 
 
 
107 aa  186  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  80.37 
 
 
107 aa  184  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  80.37 
 
 
107 aa  184  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  76.64 
 
 
109 aa  185  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  80.37 
 
 
107 aa  184  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  78.5 
 
 
107 aa  184  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  78.5 
 
 
107 aa  184  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  77.57 
 
 
124 aa  184  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  79.44 
 
 
107 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  81.37 
 
 
125 aa  183  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  70.75 
 
 
123 aa  173  7e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  72.55 
 
 
108 aa  167  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  74.77 
 
 
110 aa  165  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  64 
 
 
108 aa  150  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  61 
 
 
120 aa  147  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  59.8 
 
 
108 aa  147  6e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  64.29 
 
 
115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  62.5 
 
 
105 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  62 
 
 
106 aa  144  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  60.78 
 
 
107 aa  144  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  60 
 
 
109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  60.78 
 
 
107 aa  144  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  60.78 
 
 
107 aa  144  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  59.8 
 
 
107 aa  142  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  64.29 
 
 
105 aa  142  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  62.63 
 
 
110 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  60.61 
 
 
107 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  62.14 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  56.86 
 
 
110 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  55.34 
 
 
107 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  57 
 
 
109 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  56.19 
 
 
106 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  55.88 
 
 
109 aa  137  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  55 
 
 
107 aa  137  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  59.22 
 
 
108 aa  136  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  52.43 
 
 
107 aa  135  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  59.6 
 
 
107 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  55 
 
 
114 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  57 
 
 
109 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  53.77 
 
 
223 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  56 
 
 
109 aa  134  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  59.6 
 
 
106 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  55.88 
 
 
107 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  56 
 
 
108 aa  133  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  54.9 
 
 
107 aa  133  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  54.9 
 
 
109 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  54.29 
 
 
109 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  56.07 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  58.42 
 
 
114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  57.01 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  58 
 
 
259 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  52.94 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  56.44 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  54 
 
 
109 aa  131  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  58.51 
 
 
108 aa  131  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  50.96 
 
 
109 aa  131  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  57.84 
 
 
106 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  131  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  57.84 
 
 
119 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  54.21 
 
 
108 aa  131  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  53.92 
 
 
108 aa  131  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  60.61 
 
 
109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  57.01 
 
 
108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  51.4 
 
 
113 aa  130  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  57.58 
 
 
106 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  56.12 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  52.34 
 
 
106 aa  130  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  53.27 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  54.21 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  59.6 
 
 
109 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  56.57 
 
 
106 aa  130  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  50.96 
 
 
109 aa  130  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  59.6 
 
 
109 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  53.27 
 
 
109 aa  130  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  55.14 
 
 
113 aa  130  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  56.86 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  53.85 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  58.76 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  50.98 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  55.88 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  55 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  50.98 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  56.57 
 
 
106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  53.92 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  56.07 
 
 
109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  51.89 
 
 
110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>