More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2629 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  40.31 
 
 
1188 aa  839    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  41.49 
 
 
1193 aa  880    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  39.67 
 
 
1208 aa  784    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 
1221 aa  2518    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  40.34 
 
 
1196 aa  818    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  39.12 
 
 
1190 aa  781    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  37.28 
 
 
1213 aa  833    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  33.98 
 
 
1209 aa  623  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  46.45 
 
 
1474 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  33.67 
 
 
1247 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  46.86 
 
 
1443 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  33.54 
 
 
1411 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  48.36 
 
 
1363 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  49.06 
 
 
696 aa  536  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  29.21 
 
 
1188 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  45.27 
 
 
1652 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  47.44 
 
 
1163 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  47.75 
 
 
1236 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.36 
 
 
1557 aa  502  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  43.45 
 
 
1789 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  44.3 
 
 
947 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  37.22 
 
 
1523 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  47.33 
 
 
1364 aa  486  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  44.55 
 
 
1357 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.77 
 
 
1686 aa  466  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  37.52 
 
 
1831 aa  463  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  41.99 
 
 
1510 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  39.53 
 
 
1868 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.48 
 
 
1481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  42.78 
 
 
1553 aa  452  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.22 
 
 
1711 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  42.95 
 
 
919 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  39.59 
 
 
1454 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  44.17 
 
 
1217 aa  426  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  38.23 
 
 
1552 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  43.97 
 
 
1661 aa  403  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.3 
 
 
1262 aa  399  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  36.04 
 
 
1901 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.07 
 
 
1760 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  43.37 
 
 
1656 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  37.29 
 
 
1211 aa  392  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  39.09 
 
 
1229 aa  389  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  42.91 
 
 
1714 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  34.62 
 
 
1807 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.58 
 
 
1609 aa  386  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  39.31 
 
 
1348 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  37.63 
 
 
1367 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.66 
 
 
1583 aa  365  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.48 
 
 
930 aa  360  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.28 
 
 
1607 aa  359  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  39.15 
 
 
1176 aa  359  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  39.33 
 
 
1177 aa  358  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.2 
 
 
1598 aa  355  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  37.1 
 
 
924 aa  353  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  37.36 
 
 
1161 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  37.36 
 
 
1161 aa  350  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.2 
 
 
1547 aa  340  7e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.33 
 
 
1599 aa  339  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.61 
 
 
1626 aa  337  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  35.42 
 
 
1416 aa  336  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.32 
 
 
1617 aa  334  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  35.57 
 
 
1344 aa  333  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  33.45 
 
 
728 aa  325  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  35.15 
 
 
1209 aa  324  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  33.54 
 
 
1858 aa  323  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.47 
 
 
1684 aa  322  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  34.68 
 
 
1242 aa  317  7e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.22 
 
 
1623 aa  317  7e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  34.34 
 
 
608 aa  307  9.000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  35.39 
 
 
1766 aa  307  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  33 
 
 
1164 aa  305  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  33.02 
 
 
1373 aa  304  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.69 
 
 
1267 aa  303  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  32.12 
 
 
1214 aa  301  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  33.83 
 
 
1041 aa  301  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  42.82 
 
 
1599 aa  300  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.17 
 
 
1039 aa  299  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  34.21 
 
 
1304 aa  290  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  32.17 
 
 
1016 aa  289  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  34.95 
 
 
1280 aa  290  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  32.17 
 
 
1016 aa  289  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  37.87 
 
 
566 aa  288  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  39.09 
 
 
1878 aa  287  7e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  46.39 
 
 
1240 aa  285  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.69 
 
 
1823 aa  283  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  44.93 
 
 
344 aa  282  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.32 
 
 
740 aa  280  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  31.47 
 
 
1330 aa  278  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.07 
 
 
1856 aa  278  5e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  44.06 
 
 
344 aa  277  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  33.02 
 
 
1264 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  33.02 
 
 
1264 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.74 
 
 
677 aa  272  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  32.37 
 
 
1311 aa  271  5e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  50 
 
 
676 aa  271  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30.52 
 
 
1484 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  31.45 
 
 
1657 aa  268  5e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  29.48 
 
 
1190 aa  267  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  32.98 
 
 
565 aa  266  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 
438 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>