More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2610 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
315 aa  629  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  86.67 
 
 
315 aa  553  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  82.48 
 
 
315 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  78.73 
 
 
316 aa  512  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  75.8 
 
 
314 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.89 
 
 
314 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.89 
 
 
314 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  72.29 
 
 
314 aa  481  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0489  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.78 
 
 
317 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.9 
 
 
316 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18481  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.97 
 
 
316 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.672263 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15691  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.03 
 
 
316 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0980  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.66 
 
 
316 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04841  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.42 
 
 
316 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16291  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.46 
 
 
316 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16521  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.83 
 
 
316 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.83 
 
 
316 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.83 
 
 
316 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.198196  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20657  precursor of ATPase ATPase gamma subunit  59.16 
 
 
369 aa  357  9.999999999999999e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363655  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  53.29 
 
 
365 aa  343  2e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.46 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  41.08 
 
 
295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.45 
 
 
282 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.73 
 
 
286 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.68 
 
 
286 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.68 
 
 
286 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.68 
 
 
286 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.05 
 
 
286 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.68 
 
 
286 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.05 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.73 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.73 
 
 
286 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.53 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  39.03 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.05 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.81 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.73 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.37 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.49 
 
 
288 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.05 
 
 
286 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  39.49 
 
 
289 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
286 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.73 
 
 
286 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
289 aa  210  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
286 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.81 
 
 
283 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.25 
 
 
291 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  41.72 
 
 
287 aa  209  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
287 aa  209  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.26 
 
 
288 aa  208  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
290 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.22 
 
 
287 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.17 
 
 
287 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
287 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.58 
 
 
286 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.68 
 
 
290 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  40 
 
 
309 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.68 
 
 
290 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  38.1 
 
 
286 aa  205  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.03 
 
 
289 aa  205  8e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
286 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  38.39 
 
 
286 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  37.46 
 
 
291 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  36.34 
 
 
290 aa  204  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.9 
 
 
287 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
287 aa  203  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
287 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
287 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  37.54 
 
 
326 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.49 
 
 
288 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.78 
 
 
288 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.75 
 
 
295 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.08 
 
 
288 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.08 
 
 
288 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.68 
 
 
289 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.65 
 
 
287 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1026  ATP synthase F1, gamma subunit  34.29 
 
 
295 aa  202  5e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.92 
 
 
293 aa  202  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.97 
 
 
309 aa  202  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  37.46 
 
 
288 aa  201  9e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.39 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  37.58 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.24 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.78 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.97 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.78 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.37 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  38.18 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.74 
 
 
295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3285  ATP synthase F1, gamma subunit  37.22 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
288 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  40.19 
 
 
299 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.62 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.62 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  37.74 
 
 
304 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>