More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2587 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  100 
 
 
400 aa  797    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  68.16 
 
 
414 aa  561  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  48.63 
 
 
399 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  44.08 
 
 
434 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  45.85 
 
 
399 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  42.59 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  43.23 
 
 
607 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  44.59 
 
 
399 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  42.37 
 
 
444 aa  302  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  40.98 
 
 
439 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  41.04 
 
 
406 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  41.31 
 
 
408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  39.11 
 
 
438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  38.88 
 
 
438 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  39.5 
 
 
361 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  36.84 
 
 
479 aa  249  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  38.9 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  37.41 
 
 
474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  37.76 
 
 
366 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2782  multidrug resistance efflux pump-like  29.22 
 
 
401 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623045 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10151  ABC transporter  28.03 
 
 
339 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279055  normal  0.0324657 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07841  ABC transporter  28.19 
 
 
305 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.519134  normal  0.581316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  27.89 
 
 
305 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  28.49 
 
 
294 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1252  ABC transporter  28.53 
 
 
304 aa  113  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  29.13 
 
 
517 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0756  ABC transporter component-like  27.1 
 
 
304 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270032  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  25.54 
 
 
345 aa  92.8  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08091  ABC transporter  26.12 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.600867  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  26.67 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08081  ABC transporter  25.41 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.43 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1217  ABC transporter  31.41 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.394025  normal  0.703789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  25.36 
 
 
500 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  29.64 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08361  ABC transporter  29.35 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.33 
 
 
504 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  29.24 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.12 
 
 
467 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  26.3 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  24.52 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.9 
 
 
448 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  26.16 
 
 
335 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  24.74 
 
 
471 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  24.06 
 
 
353 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.23 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  26.62 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.25 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  30.32 
 
 
364 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  25.37 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.69 
 
 
479 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.31 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  26.62 
 
 
363 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  23.75 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  26.5 
 
 
395 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  24.34 
 
 
329 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  26.28 
 
 
363 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  26.28 
 
 
364 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  25.61 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  26.28 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  26.28 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 
424 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  25.51 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  28.74 
 
 
354 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.33 
 
 
496 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  26.74 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  24.77 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  24.52 
 
 
358 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  26.62 
 
 
364 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.33 
 
 
496 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  26.67 
 
 
344 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  27.3 
 
 
349 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  25.82 
 
 
335 aa  60.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  24.78 
 
 
366 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  25.51 
 
 
378 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.83 
 
 
445 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  26.54 
 
 
358 aa  59.3  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  26.81 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  25.86 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.55 
 
 
453 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  29.56 
 
 
355 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.41 
 
 
500 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  25.32 
 
 
510 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2323  secretion protein HlyD  32.58 
 
 
231 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000671168  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  26.18 
 
 
374 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  26.32 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  26.32 
 
 
360 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  28.38 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.55 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  23.96 
 
 
400 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  39.51 
 
 
366 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.02 
 
 
426 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 
417 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  25.85 
 
 
488 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  22.85 
 
 
359 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  27.55 
 
 
421 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  25.5 
 
 
398 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.79 
 
 
421 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>