42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2569 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3094  virulence-associated E  61.78 
 
 
662 aa  859    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000820429  normal  0.712426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  100 
 
 
697 aa  1458    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  30.73 
 
 
812 aa  184  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  35.48 
 
 
744 aa  167  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  32.82 
 
 
739 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  33.79 
 
 
736 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1196  virulence-associated E family protein  37.07 
 
 
818 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2850  virulence-associated E family protein  37.02 
 
 
788 aa  137  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000089982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0384  virulence-associated protein E  37.02 
 
 
788 aa  137  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  27.91 
 
 
835 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  30.82 
 
 
695 aa  126  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1984  virulence-associated E family protein  32.76 
 
 
509 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  28.87 
 
 
896 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3095  virulence-associated E family protein  30.77 
 
 
413 aa  120  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1072  virulence-associated E family protein  30.53 
 
 
815 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1053  virulence-associated E family protein  30.53 
 
 
815 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.957725  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1098  virulence-associated protein E, putative  32.61 
 
 
789 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1690  virulence-associated E family protein  30.34 
 
 
489 aa  117  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.879464  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  31.62 
 
 
778 aa  117  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3057  virulence-associated E family protein  29.36 
 
 
789 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1237  virulence-associated E family protein  30.67 
 
 
781 aa  111  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000496901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  32.19 
 
 
892 aa  110  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1431  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like  30.81 
 
 
400 aa  109  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  28.2 
 
 
761 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000885028  normal 
 
 
 
NC_013517  Sterm_1413  virulence-associated E family protein  31.71 
 
 
806 aa  105  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0404  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  25.98 
 
 
431 aa  92.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  31.09 
 
 
736 aa  91.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1212  virulence-associated E family protein  25.2 
 
 
725 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5333  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  28.42 
 
 
749 aa  81.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.300834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3284  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  27.89 
 
 
748 aa  77.8  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.832553  normal  0.553227 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0427  virulence-associated protein E  27.67 
 
 
476 aa  65.9  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0933  hypothetical protein  32.79 
 
 
218 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3238  hypothetical protein  28.12 
 
 
947 aa  62.4  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0772641  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0934  hypothetical protein  27.12 
 
 
181 aa  53.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0010  replication protein  23.57 
 
 
406 aa  51.2  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.700386  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3313  hypothetical protein  22.65 
 
 
444 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  34.58 
 
 
987 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  30.89 
 
 
874 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  30.89 
 
 
874 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  44.83 
 
 
833 aa  47  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0633  replication protein  22.22 
 
 
368 aa  45.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2941  hypothetical protein  21.95 
 
 
641 aa  44.3  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0131968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>