More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2549 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
130 aa  256  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  1.88294e-09  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1043  50S ribosomal protein L19  90 
 
 
120 aa  217  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  5.55964e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  80 
 
 
120 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05301  50S ribosomal protein L19  75.41 
 
 
159 aa  195  2e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0268  50S ribosomal protein L19  77.95 
 
 
127 aa  193  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.118712  normal  0.0551314 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  77.69 
 
 
137 aa  192  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  75 
 
 
159 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  79.17 
 
 
120 aa  189  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  79.17 
 
 
120 aa  189  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1023  ribosomal protein L19  79.17 
 
 
120 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00623227 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05391  50S ribosomal protein L19  73.5 
 
 
156 aa  187  6e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.589917  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0643  50S ribosomal protein L19  72.88 
 
 
158 aa  185  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1716  50S ribosomal protein L19  72.03 
 
 
150 aa  185  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0475  50S ribosomal protein L19  71.67 
 
 
156 aa  183  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1808  50S ribosomal protein L19  70.83 
 
 
162 aa  182  1e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0350868  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06821  50S ribosomal protein L19  72.03 
 
 
158 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05311  50S ribosomal protein L19  71.43 
 
 
162 aa  180  5e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.105613 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04761  ribosomal protein L19  68.03 
 
 
163 aa  177  6e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.603852  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 
116 aa  139  1e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 
114 aa  139  1e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  3.8778e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  64.22 
 
 
113 aa  137  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.49666e-12  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 
116 aa  135  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.64859e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  59.48 
 
 
118 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  8.54826e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 
115 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  58.93 
 
 
124 aa  134  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.05105e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 
115 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  61.21 
 
 
131 aa  133  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
114 aa  133  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  60.55 
 
 
118 aa  133  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.21036e-06  hitchhiker  4.87764e-07 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 
128 aa  132  1e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.07565e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  59.83 
 
 
134 aa  132  2e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  58.56 
 
 
117 aa  132  2e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.31397e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 
120 aa  132  2e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  59.83 
 
 
134 aa  132  2e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  59.63 
 
 
118 aa  132  2e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 
114 aa  132  2e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  4.23852e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  59.63 
 
 
118 aa  132  2e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.55115e-20 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
117 aa  132  2e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 
114 aa  132  2e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.3876e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  62.26 
 
 
119 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 
145 aa  131  4e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  56.78 
 
 
128 aa  130  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  7.97714e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  58.97 
 
 
148 aa  130  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  61.47 
 
 
115 aa  130  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 
114 aa  130  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  5.97471e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 
116 aa  130  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  1.1018e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  58.72 
 
 
115 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.578e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  61.32 
 
 
118 aa  130  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.21347e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 
118 aa  130  8e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1206  50S ribosomal protein L19  54.78 
 
 
118 aa  130  8e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  4.37176e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 
113 aa  130  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.80352e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  59.63 
 
 
114 aa  129  1e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 
120 aa  129  1e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  58.62 
 
 
132 aa  129  1e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 
115 aa  129  1e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.97862e-10  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  57.14 
 
 
140 aa  129  1e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  59.48 
 
 
130 aa  129  1e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 
116 aa  129  2e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1476  ribosomal protein L19  55.36 
 
 
116 aa  129  2e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735287  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
117 aa  129  2e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.54416e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1285  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 
116 aa  129  2e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.329  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.43455e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.05797e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
116 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  9.73438e-05  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.47607e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.38289e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  128  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
116 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.65599e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  8.91936e-09  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
116 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  58.56 
 
 
118 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.84782e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.63076e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
116 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
116 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 
115 aa  127  4e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 
115 aa  127  4e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 
116 aa  127  4e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 
116 aa  127  4e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  1.50512e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  58.56 
 
 
116 aa  127  4e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  4.84447e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 
116 aa  127  4e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 
116 aa  127  4e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  3.48159e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 
115 aa  127  5e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  57.52 
 
 
124 aa  126  8e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  55.26 
 
 
118 aa  126  9e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
115 aa  126  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
115 aa  126  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  55.96 
 
 
119 aa  125  1e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  52.14 
 
 
119 aa  126  1e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
115 aa  126  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
115 aa  126  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
115 aa  126  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0076  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 
136 aa  125  2e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1533  ribosomal protein L19  63.64 
 
 
118 aa  125  2e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121036  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  55.93 
 
 
145 aa  125  2e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  55.96 
 
 
121 aa  125  2e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  55.93 
 
 
145 aa  125  2e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0090  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 
136 aa  125  2e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
115 aa  124  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>