More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2548 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
236 aa  488  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  9.44763e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  73.62 
 
 
245 aa  336  2e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
217 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 
229 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  35.21 
 
 
264 aa  83.6  2e-15  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 
227 aa  83.6  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
203 aa  83.6  3e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  37.39 
 
 
215 aa  77  2e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 
217 aa  75.1  9e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
203 aa  74.7  1e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 
218 aa  74.7  1e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
208 aa  74.3  2e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  25.62 
 
 
215 aa  73.6  2e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
229 aa  73.2  4e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 
218 aa  72.4  6e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 
196 aa  72.4  6e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
207 aa  72  7e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
214 aa  71.6  1e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  26.09 
 
 
212 aa  70.5  2e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
208 aa  70.5  2e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 
218 aa  70.1  3e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  33.61 
 
 
258 aa  70.1  3e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
209 aa  70.1  3e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
205 aa  69.3  4e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 
218 aa  68.9  6e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 
207 aa  68.9  7e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 
195 aa  67.4  2e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
215 aa  67  2e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
220 aa  67  2e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  40.24 
 
 
225 aa  67  2e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
223 aa  67.4  2e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 
204 aa  67  3e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
223 aa  65.5  7e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 
213 aa  65.1  9e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
221 aa  64.7  1e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
221 aa  64.7  1e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
220 aa  63.5  2e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 
210 aa  63.9  2e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 
208 aa  63.9  2e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
198 aa  64.3  2e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
195 aa  64.3  2e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
195 aa  64.3  2e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
193 aa  63.9  2e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 
218 aa  63.5  3e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 
218 aa  63.5  3e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  39.42 
 
 
197 aa  63.2  4e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 
207 aa  62.8  5e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
218 aa  62.4  6e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
199 aa  62.4  6e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
242 aa  61.6  9e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  8.08903e-07 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
253 aa  61.2  1e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 
203 aa  61.6  1e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 
203 aa  61.6  1e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
231 aa  60.8  2e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
257 aa  60.8  2e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 
218 aa  60.8  2e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
198 aa  60.8  2e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
224 aa  59.7  4e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
233 aa  58.5  8e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
219 aa  58.5  9e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
239 aa  58.5  9e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
216 aa  58.2  1e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
192 aa  58.2  1e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0437  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 
213 aa  58.2  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
220 aa  57.8  1e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
205 aa  57  2e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
218 aa  57.4  2e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
208 aa  57.4  2e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 
214 aa  56.6  3e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2043  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
212 aa  56.6  3e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 
201 aa  56.6  3e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
236 aa  56.2  4e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  40.91 
 
 
216 aa  56.2  4e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 
238 aa  55.8  5e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
213 aa  55.8  6e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
214 aa  55.8  6e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 
176 aa  55.5  7e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
208 aa  55.5  7e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 
239 aa  55.5  8e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  38.16 
 
 
222 aa  55.5  8e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
239 aa  54.7  1e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
184 aa  54.7  1e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
205 aa  53.9  2e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
209 aa  53.9  2e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
209 aa  53.9  2e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
209 aa  54.3  2e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
295 aa  53.9  2e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 
200 aa  53.5  3e-06  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
215 aa  53.1  3e-06  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
202 aa  53.5  3e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  30.99 
 
 
215 aa  53.5  3e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
210 aa  53.1  4e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
218 aa  52.8  5e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
184 aa  52.8  5e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
218 aa  52.8  5e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 
210 aa  52.8  5e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
210 aa  52.8  5e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
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NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
218 aa  52.8  5e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11151 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 
210 aa  52.8  5e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
205 aa  52.4  6e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal 
 
 
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