More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2537 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
235 aa  488  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  86.81 
 
 
235 aa  441  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  81.59 
 
 
239 aa  404  1e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  81.59 
 
 
239 aa  404  1e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  77.02 
 
 
247 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  81.28 
 
 
235 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  73.39 
 
 
243 aa  347  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  73.19 
 
 
213 aa  345  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  72.08 
 
 
218 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  72.83 
 
 
216 aa  298  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  71.74 
 
 
212 aa  288  7e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  69.89 
 
 
214 aa  285  6e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  69.89 
 
 
214 aa  285  6e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  64.4 
 
 
219 aa  259  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  65.75 
 
 
223 aa  253  2e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  64.29 
 
 
218 aa  253  2e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  62.37 
 
 
226 aa  250  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  57.56 
 
 
435 aa  248  5e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  63.54 
 
 
223 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  62.92 
 
 
270 aa  245  3e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  62.16 
 
 
219 aa  245  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  64.74 
 
 
186 aa  244  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  64.16 
 
 
186 aa  243  2e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  60.22 
 
 
189 aa  243  2e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  64.97 
 
 
216 aa  242  4e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  61.93 
 
 
190 aa  240  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  64.16 
 
 
181 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  64.16 
 
 
181 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  61.36 
 
 
190 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  59.34 
 
 
186 aa  239  3e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  61.36 
 
 
190 aa  238  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  62.21 
 
 
202 aa  238  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  63.01 
 
 
181 aa  238  7e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  62.43 
 
 
186 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  60.34 
 
 
186 aa  237  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  58.79 
 
 
186 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  57.78 
 
 
184 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  59.34 
 
 
185 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 
186 aa  235  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  60.69 
 
 
187 aa  234  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  62.43 
 
 
181 aa  234  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  62.5 
 
 
185 aa  234  8e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  58.24 
 
 
186 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 
213 aa  233  1e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  63.58 
 
 
181 aa  233  2e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  61.85 
 
 
181 aa  233  2e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350099 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  57.45 
 
 
329 aa  233  2e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  55.73 
 
 
199 aa  232  4e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  59.44 
 
 
190 aa  231  8e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  60.69 
 
 
181 aa  230  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  62.21 
 
 
181 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  56.99 
 
 
201 aa  229  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  61.83 
 
 
226 aa  229  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  56.85 
 
 
200 aa  229  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  58.38 
 
 
198 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  6.26036e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  59.54 
 
 
187 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  58.86 
 
 
195 aa  228  8e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  62.57 
 
 
193 aa  228  8e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  54.7 
 
 
188 aa  227  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  54.7 
 
 
184 aa  227  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  64.2 
 
 
225 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  60.57 
 
 
190 aa  226  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 
190 aa  225  4e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  58.33 
 
 
199 aa  224  8e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  56.42 
 
 
179 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  62.79 
 
 
224 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  57.78 
 
 
220 aa  221  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  56.73 
 
 
179 aa  221  1e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  59.89 
 
 
217 aa  220  1e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  58.05 
 
 
180 aa  221  1e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  57.07 
 
 
195 aa  220  1e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  62.79 
 
 
181 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  62.21 
 
 
181 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  53.89 
 
 
184 aa  218  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  56.07 
 
 
179 aa  218  8e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  53.68 
 
 
194 aa  217  1e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  56.25 
 
 
193 aa  217  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  62.21 
 
 
190 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  56.41 
 
 
257 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  55.49 
 
 
179 aa  216  3e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 
213 aa  214  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  57.23 
 
 
210 aa  214  1e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  54.6 
 
 
182 aa  214  1e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 
213 aa  213  2e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  51.53 
 
 
203 aa  210  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 
193 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  56.07 
 
 
201 aa  210  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  9.98174e-12  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  49.01 
 
 
211 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  56.08 
 
 
210 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  54.79 
 
 
207 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  55.49 
 
 
185 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 
200 aa  208  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  51.67 
 
 
181 aa  208  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  52.82 
 
 
200 aa  207  9e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  53.68 
 
 
213 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  57.07 
 
 
187 aa  206  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  52.41 
 
 
189 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  57.92 
 
 
198 aa  205  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  48.91 
 
 
206 aa  206  4e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  44.64 
 
 
269 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.131431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>