119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2510 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  100 
 
 
574 aa  1151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  3.93409e-11  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  76.43 
 
 
561 aa  827  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  7.85609e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  66.32 
 
 
533 aa  718  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  45.99 
 
 
639 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  44.55 
 
 
641 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.95418e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  46.84 
 
 
531 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  48.5 
 
 
563 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  6.60522e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  42.22 
 
 
666 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  42.22 
 
 
666 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  4.73343e-05  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  47.15 
 
 
539 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  44.76 
 
 
542 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  48.05 
 
 
529 aa  407  1e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  39.53 
 
 
581 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  8.41951e-11  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  39.9 
 
 
572 aa  365  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  43.24 
 
 
530 aa  357  2e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  41.06 
 
 
604 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  38.8 
 
 
550 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  42.3 
 
 
491 aa  348  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  44.11 
 
 
624 aa  347  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  42.23 
 
 
571 aa  343  3e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  38.44 
 
 
658 aa  343  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  3.90313e-05  unclonable  2.85099e-10 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  40.68 
 
 
550 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  36.68 
 
 
600 aa  340  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  39.13 
 
 
622 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  36.32 
 
 
551 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  36.57 
 
 
586 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  34.78 
 
 
581 aa  310  6e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  34.78 
 
 
581 aa  310  6e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  36.41 
 
 
586 aa  308  2e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  35.48 
 
 
593 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  34.73 
 
 
591 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  38.99 
 
 
543 aa  287  3e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  39.4 
 
 
606 aa  279  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  38.36 
 
 
548 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  35.63 
 
 
508 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  37.45 
 
 
531 aa  263  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  5.40569e-06  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  36.93 
 
 
518 aa  262  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  39.2 
 
 
510 aa  254  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  35.99 
 
 
543 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  30.83 
 
 
589 aa  249  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  38.55 
 
 
645 aa  246  1e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  38.89 
 
 
513 aa  246  1e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  38.11 
 
 
632 aa  246  1e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  38.85 
 
 
500 aa  243  6e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  34.22 
 
 
555 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  35.6 
 
 
578 aa  237  5e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  34.02 
 
 
531 aa  236  1e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  36.62 
 
 
561 aa  233  7e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  35.58 
 
 
524 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  35.42 
 
 
528 aa  223  7e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  42.94 
 
 
643 aa  218  3e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  9.00458e-06  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  34.91 
 
 
518 aa  216  8e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  34.36 
 
 
514 aa  214  4e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  39.13 
 
 
475 aa  214  4e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  56.78 
 
 
629 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  1.42849e-05  unclonable  4.25549e-10 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  31.2 
 
 
568 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  33.09 
 
 
527 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  30.3 
 
 
544 aa  160  7e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  63.71 
 
 
188 aa  159  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  28.13 
 
 
515 aa  132  1e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  34.35 
 
 
450 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  5.55529e-05 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  28.83 
 
 
515 aa  120  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  39.1 
 
 
261 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  56.06 
 
 
262 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  56.06 
 
 
262 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  26.85 
 
 
426 aa  86.7  1e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  25.5 
 
 
415 aa  84.7  4e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  25.16 
 
 
437 aa  82.8  1e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  25.58 
 
 
414 aa  80.1  1e-13  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  32.94 
 
 
485 aa  79  2e-13  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  3.76078e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  24.89 
 
 
432 aa  78.6  3e-13  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  25 
 
 
432 aa  75.9  2e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  31.86 
 
 
440 aa  75.5  3e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  28.77 
 
 
449 aa  74.7  4e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  41.07 
 
 
416 aa  68.6  3e-10  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  39.39 
 
 
946 aa  66.2  2e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  36.54 
 
 
932 aa  63.9  8e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  1.40027e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  35.29 
 
 
673 aa  61.2  5e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  38.24 
 
 
919 aa  60.5  7e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  3.09483e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  25.63 
 
 
384 aa  58.9  2e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  25 
 
 
415 aa  58.5  3e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  27.66 
 
 
784 aa  57.4  7e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  30.25 
 
 
330 aa  55.8  2e-06  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  32.12 
 
 
424 aa  55.5  3e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  23.43 
 
 
431 aa  54.3  5e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  35.21 
 
 
441 aa  54.3  6e-06  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.17367e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  43.64 
 
 
413 aa  52.8  2e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  24.2 
 
 
383 aa  52.8  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3271  hypothetical protein  23.33 
 
 
469 aa  53.1  2e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  29.09 
 
 
361 aa  52.8  2e-05  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  30.61 
 
 
186 aa  51.6  3e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.85925e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  40.43 
 
 
1036 aa  52  3e-05  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  37.88 
 
 
400 aa  52  3e-05  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  6.1041e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  30.16 
 
 
400 aa  52  3e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  1.89503e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  36.63 
 
 
408 aa  51.6  4e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  29.13 
 
 
255 aa  51.6  4e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  42.86 
 
 
414 aa  51.2  5e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  40.74 
 
 
1821 aa  50.4  8e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  22.73 
 
 
390 aa  50.4  8e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  29.75 
 
 
403 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  9.1055e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>