More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2410 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
295 aa  599  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  1.12748e-07 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  61.28 
 
 
294 aa  363  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  51.62 
 
 
305 aa  282  4e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0826  Peptidase M23  51.55 
 
 
281 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  51.55 
 
 
281 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0287  Peptidase M23  48.47 
 
 
297 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  32.48 
 
 
283 aa  131  1e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  31.15 
 
 
363 aa  130  4e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  31.98 
 
 
274 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.10987e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  31.54 
 
 
307 aa  124  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  32.64 
 
 
430 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  34.68 
 
 
271 aa  122  1e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  29.3 
 
 
412 aa  120  2e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  30.94 
 
 
417 aa  121  2e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  34.4 
 
 
271 aa  119  4e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  30.28 
 
 
265 aa  114  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  29.7 
 
 
419 aa  113  4e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.79397e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  32.1 
 
 
271 aa  112  7e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  45.38 
 
 
288 aa  112  1e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  4.16895e-06  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  46.4 
 
 
610 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  48.31 
 
 
314 aa  108  9e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  35.75 
 
 
430 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  43.85 
 
 
400 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  45.24 
 
 
529 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  30.83 
 
 
278 aa  106  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  42.31 
 
 
388 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  44.07 
 
 
300 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  39.19 
 
 
455 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  42.67 
 
 
399 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  42.67 
 
 
399 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  45.53 
 
 
288 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  33.09 
 
 
297 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  30.82 
 
 
402 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  44.44 
 
 
523 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  41.67 
 
 
347 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  32.46 
 
 
448 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  44.26 
 
 
384 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  41.54 
 
 
216 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  40 
 
 
460 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  29.92 
 
 
295 aa  100  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  48.11 
 
 
415 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  45.3 
 
 
377 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  40 
 
 
454 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  51.11 
 
 
375 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  1.52343e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  44.92 
 
 
411 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  43.2 
 
 
456 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  44.17 
 
 
290 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  29.56 
 
 
468 aa  99.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  44.17 
 
 
316 aa  99.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1555  Peptidase M23  45.97 
 
 
469 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  41.74 
 
 
414 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1579  Peptidase M23  45.97 
 
 
469 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  40.38 
 
 
538 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  54.55 
 
 
460 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  43.2 
 
 
459 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  43.85 
 
 
376 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.73675e-08  hitchhiker  4.27958e-09 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  42.98 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  45.13 
 
 
377 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  40.87 
 
 
423 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  46.08 
 
 
387 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  42.42 
 
 
390 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  42.02 
 
 
402 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  42.86 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  1.08635e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  40.8 
 
 
453 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  41.6 
 
 
457 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  41.67 
 
 
475 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  43.55 
 
 
372 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  47.62 
 
 
491 aa  96.3  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  45.16 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  50 
 
 
382 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  38.14 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  38.14 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  41.18 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  4.62301e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  52.27 
 
 
446 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  42.98 
 
 
404 aa  95.9  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  38.14 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  41.6 
 
 
605 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  45.76 
 
 
402 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  43.7 
 
 
300 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  40.94 
 
 
375 aa  95.5  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  43.22 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  45.45 
 
 
394 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  43.22 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  6.81555e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  46.28 
 
 
420 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  50 
 
 
489 aa  95.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  39.2 
 
 
455 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  41.67 
 
 
687 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  43.1 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  40.71 
 
 
392 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  41.53 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  49.02 
 
 
243 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  45.45 
 
 
400 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  40.83 
 
 
302 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  45.45 
 
 
421 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  42.15 
 
 
328 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  41.8 
 
 
340 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  45.45 
 
 
421 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  46.08 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  40.71 
 
 
391 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  30.34 
 
 
314 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.36198e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>