More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2298 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  68.94 
 
 
518 aa  637    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 
460 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  67.45 
 
 
460 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.55 
 
 
470 aa  681    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5413  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.66 
 
 
458 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16281  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.63 
 
 
486 aa  786    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.210886  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 
460 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.01 
 
 
484 aa  641    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  70 
 
 
517 aa  648    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.67 
 
 
468 aa  666    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0308  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 
468 aa  654    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0848804 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 
465 aa  653    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.59 
 
 
521 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  95.85 
 
 
482 aa  931    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  67.87 
 
 
459 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.82 
 
 
469 aa  664    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.82 
 
 
469 aa  664    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.82 
 
 
469 aa  664    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0197  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.32 
 
 
471 aa  655    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 
458 aa  635    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 
458 aa  635    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.49 
 
 
470 aa  671    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
463 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.25 
 
 
477 aa  650    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.04 
 
 
480 aa  643    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0970  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.91 
 
 
488 aa  771    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3346  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.4 
 
 
467 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185597  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.7 
 
 
476 aa  654    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 
470 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.96 
 
 
476 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
482 aa  968    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05021  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.06 
 
 
532 aa  772    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.59 
 
 
521 aa  649    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  67.46 
 
 
503 aa  635    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.94 
 
 
475 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.3 
 
 
468 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.3 
 
 
468 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18381  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.13 
 
 
488 aa  772    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.61509  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.21 
 
 
482 aa  671    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0504  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.28 
 
 
487 aa  774    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0754046  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.64 
 
 
462 aa  678    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2171  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.49 
 
 
487 aa  770    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.34 
 
 
470 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.51 
 
 
470 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2165  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 
459 aa  648    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.82 
 
 
469 aa  664    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0026  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.94 
 
 
466 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1531  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.84 
 
 
486 aa  786    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.89 
 
 
484 aa  824    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.12 
 
 
537 aa  642    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.38 
 
 
474 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.4 
 
 
462 aa  689    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.52 
 
 
484 aa  648    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.07 
 
 
482 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.76 
 
 
471 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.96 
 
 
476 aa  655    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.41 
 
 
481 aa  655    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.43 
 
 
464 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0255  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.66 
 
 
474 aa  651    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0651281  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.7 
 
 
474 aa  656    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 
474 aa  653    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3966  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.75 
 
 
470 aa  651    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000531769  normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.17 
 
 
476 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0480  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.3 
 
 
471 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0327  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 
467 aa  651    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.713422  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16401  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.59 
 
 
486 aa  786    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
463 aa  636    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.96 
 
 
476 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
458 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.33 
 
 
476 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2327  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.04 
 
 
477 aa  647    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.568138  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3494  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.4 
 
 
467 aa  634    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000137861  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.79 
 
 
462 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  70 
 
 
474 aa  657    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.08 
 
 
513 aa  648    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.94 
 
 
475 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 
513 aa  640    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 
465 aa  653    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.61 
 
 
519 aa  667    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
465 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
465 aa  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.97 
 
 
475 aa  652    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.48 
 
 
484 aa  824    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.75 
 
 
509 aa  661    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5295  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.66 
 
 
458 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.122474 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
458 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
463 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.92 
 
 
476 aa  635    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16171  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.7 
 
 
486 aa  776    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  68.62 
 
 
530 aa  665    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.97 
 
 
472 aa  637    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.15 
 
 
475 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.61 
 
 
464 aa  657    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.55 
 
 
471 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.3 
 
 
474 aa  643    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
463 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.37 
 
 
469 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.84 
 
 
474 aa  643    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.91 
 
 
481 aa  696    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0372  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.23 
 
 
476 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.678758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>