158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2248 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  40.34 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  36.72 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  37.16 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 195 aa  121  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  35.75 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  33.15 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  33.87 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  32.96 
 
 		 179 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  32.96 
 
 		 179 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  34.29 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3673  PadR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  34.1 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  31.02 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  32.04 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  30.53 
 
 		 195 aa  94.4  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  32.6 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  30.06 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  41 
 
 		 203 aa  87  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  37.82 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4651  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0244523  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  26.06 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  28.26 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2796  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  33.06 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  40.4 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  30.6 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  38.61 
 
 		 305 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  30.94 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  35.71 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  27.38 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  25.97 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  25.97 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  23.63 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  40.48 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  27.49 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  31.73 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  24.14 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1177  transcriptional regulator, PadR-like family  28.65 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0592255  hitchhiker  0.00870551 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07680  predicted transcriptional regulator  29.79 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  32.38 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  38.27 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  24.73 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  27.78 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  24.86 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  27.49 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 248 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 248 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  24.12 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 221 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  28.89 
 
 		 176 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  23.08 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  28.69 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  25.7 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  28.04 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0943  transcriptional regulator, PadR-like family  29.17 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  31.87 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>