More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2236 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  60.34 
 
 		 586 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 582 aa  1186    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  57.85 
 
 		 586 aa  685    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  58.71 
 
 		 581 aa  647    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  79.55 
 
 		 575 aa  954    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  60.28 
 
 		 595 aa  675    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  61.62 
 
 		 592 aa  701    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  57.85 
 
 		 586 aa  685    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2692  DNA repair protein RecN  40.62 
 
 		 560 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  40.14 
 
 		 562 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2318  DNA repair protein RecN  39.3 
 
 		 561 aa  361  2e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  39.11 
 
 		 557 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18511  DNA repair protein recN, ABC transporter  37.85 
 
 		 568 aa  334  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0157571  normal  0.0737248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  34.81 
 
 		 580 aa  334  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.56 
 
 		 577 aa  332  9e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  36.25 
 
 		 573 aa  319  7e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  34.22 
 
 		 579 aa  320  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  34.06 
 
 		 579 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  34.22 
 
 		 579 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  34.51 
 
 		 565 aa  318  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.25 
 
 		 558 aa  316  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  33.89 
 
 		 579 aa  316  7e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33.89 
 
 		 579 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  33.78 
 
 		 583 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  33.89 
 
 		 579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  33.78 
 
 		 583 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  33.72 
 
 		 579 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  33.72 
 
 		 579 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 561 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  34.46 
 
 		 566 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1324  ATPase  32.93 
 
 		 561 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  34.03 
 
 		 565 aa  310  5.9999999999999995e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21971  DNA repair protein RecN, ABC transporter  33.1 
 
 		 561 aa  309  8e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  33.96 
 
 		 567 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.28 
 
 		 554 aa  306  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  32.82 
 
 		 570 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  33.5 
 
 		 579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.8 
 
 		 555 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  33.56 
 
 		 562 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 601 aa  300  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  35.33 
 
 		 559 aa  298  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  33.72 
 
 		 587 aa  297  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.1 
 
 		 556 aa  295  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  34.75 
 
 		 573 aa  294  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  32.87 
 
 		 555 aa  293  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  33.2 
 
 		 562 aa  292  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  34.05 
 
 		 599 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  33.4 
 
 		 552 aa  291  3e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  33.5 
 
 		 586 aa  290  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  35.89 
 
 		 557 aa  290  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.8 
 
 		 554 aa  289  9e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 		 558 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  34.02 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  36.02 
 
 		 551 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  34.75 
 
 		 555 aa  281  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  34.39 
 
 		 560 aa  280  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  34.66 
 
 		 553 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  33.73 
 
 		 560 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  34.57 
 
 		 553 aa  276  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  32.66 
 
 		 572 aa  276  9e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 		 574 aa  276  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 572 aa  274  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  30.72 
 
 		 578 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 563 aa  273  6e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  29.72 
 
 		 562 aa  273  9e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  34.18 
 
 		 564 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35 
 
 		 553 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  31.3 
 
 		 558 aa  269  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 556 aa  268  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  31.76 
 
 		 588 aa  266  5e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  33.04 
 
 		 552 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  32.52 
 
 		 552 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  32.71 
 
 		 567 aa  264  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  32.7 
 
 		 565 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  33.05 
 
 		 552 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  33.05 
 
 		 552 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  33.05 
 
 		 552 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  33.05 
 
 		 552 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  32.14 
 
 		 589 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  31.59 
 
 		 551 aa  262  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  31.83 
 
 		 553 aa  262  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  32.32 
 
 		 565 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 		 557 aa  261  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  31.47 
 
 		 559 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  31.47 
 
 		 559 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  32.39 
 
 		 588 aa  260  6e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  32.06 
 
 		 553 aa  259  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  31.43 
 
 		 605 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  33.22 
 
 		 552 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  31.83 
 
 		 553 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  32.77 
 
 		 588 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  32.17 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 		 553 aa  257  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  32.53 
 
 		 552 aa  256  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  32.2 
 
 		 575 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  31.22 
 
 		 567 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  32.53 
 
 		 552 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  30.65 
 
 		 580 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  30.82 
 
 		 561 aa  254  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>