More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2195 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  167  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  61.19 
 
 		 71 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  61.19 
 
 		 71 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  57.58 
 
 		 72 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  55.38 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  53.03 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  52.54 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  55 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  45.83 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3538  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.902272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  42.25 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 72 aa  62  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 57 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  50 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  48.39 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  48.39 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.84 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3484  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  51.79 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 255 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1393  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2665  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000943632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 69 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 69 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 69 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  48.33 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  39.47 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1297  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  40.62 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1570  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  52.73 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1019  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  52.73 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0841  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000196105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  44.29 
 
 		 255 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>