More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2094 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 
279 aa  551  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  82.12 
 
 
277 aa  451  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  73.41 
 
 
281 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  76.59 
 
 
271 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.59 
 
 
271 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  67.4 
 
 
276 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0728  putative permease protein of sugar ABC transporter  60.98 
 
 
263 aa  311  9e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  59.35 
 
 
287 aa  308  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1938  putative permease protein of sugar ABC transporter  61.38 
 
 
274 aa  305  6e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  43.87 
 
 
277 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.7 
 
 
270 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.03 
 
 
270 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.75 
 
 
280 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
273 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  41.54 
 
 
277 aa  222  6e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.85 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
275 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  41.58 
 
 
278 aa  216  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  43.21 
 
 
278 aa  216  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
294 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.53 
 
 
305 aa  215  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0148237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
283 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
301 aa  215  8e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  38.49 
 
 
277 aa  214  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.32 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  41.67 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7346  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.69 
 
 
278 aa  212  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
290 aa  212  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
271 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
274 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
298 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
300 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  41.83 
 
 
275 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 
275 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
271 aa  208  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.63 
 
 
285 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
315 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
279 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.55 
 
 
296 aa  204  9e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 
272 aa  204  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
275 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
295 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
304 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
304 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535911  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  41.48 
 
 
271 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
299 aa  202  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
276 aa  201  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.35 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.87 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
268 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
294 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
280 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
277 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
310 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
271 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.11 
 
 
291 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
298 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
290 aa  199  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  39.07 
 
 
278 aa  199  6e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
314 aa  198  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.023503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
287 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  41.11 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  38.71 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.1 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
281 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
283 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
315 aa  195  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
291 aa  194  9e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.378357  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
272 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  37.31 
 
 
272 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
275 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
299 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
299 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
299 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
296 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5004  sugar ABC transporter permease  38.97 
 
 
316 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0638088  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  37.78 
 
 
280 aa  192  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  40.07 
 
 
293 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
279 aa  192  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
291 aa  192  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0194  MalG-type ABC sugar transport system permease component  37.97 
 
 
285 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
274 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
281 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.91 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
291 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0974901  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  39.77 
 
 
290 aa  189  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
300 aa  189  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>