134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2089 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 
637 aa  1280  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  2.12393e-07 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  65.51 
 
 
635 aa  853  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  57.76 
 
 
629 aa  704  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  68.27 
 
 
650 aa  880  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  44.26 
 
 
614 aa  482  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.34 
 
 
512 aa  108  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4133  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.39 
 
 
840 aa  104  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  27.25 
 
 
523 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1599  GTP-binding protein, HSR1-related  25.06 
 
 
500 aa  83.6  1e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  31.37 
 
 
290 aa  62.4  2e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  30.88 
 
 
290 aa  62.4  3e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  30.88 
 
 
290 aa  60.8  7e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  29 
 
 
444 aa  60.5  9e-08  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  30.88 
 
 
290 aa  59.3  2e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  30.39 
 
 
290 aa  57.8  6e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5592  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.61 
 
 
198 aa  56.6  1e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352235  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  29.9 
 
 
290 aa  56.2  2e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  25.99 
 
 
413 aa  55.8  3e-06  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  27.59 
 
 
291 aa  55.1  4e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  27.27 
 
 
831 aa  55.1  4e-06  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  29.8 
 
 
409 aa  55.1  4e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  28.39 
 
 
295 aa  53.9  8e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.9 
 
 
413 aa  53.9  8e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.41 
 
 
287 aa  53.9  9e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  28.22 
 
 
294 aa  53.1  2e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  25.93 
 
 
413 aa  52.8  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.57 
 
 
291 aa  51.6  4e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1165  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.08 
 
 
194 aa  51.6  4e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.46962e-06  decreased coverage  3.27635e-26 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1311  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.01 
 
 
198 aa  51.6  5e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0010673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.71 
 
 
205 aa  51.2  5e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.034569  normal  0.192806 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  25.84 
 
 
440 aa  51.2  6e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  27.07 
 
 
853 aa  50.8  7e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  25.77 
 
 
880 aa  50.8  7e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  27.78 
 
 
922 aa  50.8  7e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0626  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.56 
 
 
199 aa  50.8  8e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0532525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  30.15 
 
 
294 aa  50.4  9e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  30.15 
 
 
294 aa  50.4  9e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  30.67 
 
 
291 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  24.82 
 
 
875 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1096  GTP-binding proten HflX  31.25 
 
 
392 aa  49.7  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  31.06 
 
 
288 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1176  small GTP-binding protein  30.46 
 
 
392 aa  49.7  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668458  normal  0.446741 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01394  Putative uncharacterized proteinSeptin ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1M1]  39.76 
 
 
342 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  30.15 
 
 
294 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  31.06 
 
 
291 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1237  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.47 
 
 
195 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0772533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3183  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.09 
 
 
198 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04860  septin ring protein, putative  43.28 
 
 
322 aa  48.5  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39888  predicted protein  29.66 
 
 
374 aa  48.1  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.564657  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0320  small GTP-binding protein  26.92 
 
 
197 aa  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3117  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.19 
 
 
207 aa  47.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  27.21 
 
 
868 aa  47.8  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  37.66 
 
 
355 aa  47.8  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  29.27 
 
 
679 aa  47.8  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  29.27 
 
 
679 aa  47.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.6 
 
 
440 aa  47.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  28.81 
 
 
632 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  26.45 
 
 
824 aa  47.8  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  32.09 
 
 
460 aa  47.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1231  GTP-binding proten HflX  28.28 
 
 
370 aa  47.4  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  26.5 
 
 
924 aa  47.4  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  27.27 
 
 
883 aa  47.4  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  26.19 
 
 
997 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1096  GTP-binding protein HSR1-related  33.08 
 
 
193 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  6.26094e-06  hitchhiker  1.61313e-14 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0384  small GTP-binding protein  41.54 
 
 
184 aa  47.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.733016  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.6 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  25.36 
 
 
437 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  26.42 
 
 
907 aa  47  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  24.74 
 
 
287 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0333  translation initiation factor IF-2  21.83 
 
 
620 aa  47  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.792261  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.45 
 
 
413 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  29.68 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2483  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.57 
 
 
198 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.528344  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  27.42 
 
 
299 aa  46.2  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  27.64 
 
 
876 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  26.09 
 
 
832 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1765  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  24.84 
 
 
196 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1731  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  24.84 
 
 
196 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.114036  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  43.55 
 
 
328 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1318  translation initiation factor IF-2  25.35 
 
 
774 aa  46.2  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4605  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.47 
 
 
198 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4556  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.47 
 
 
198 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  29.66 
 
 
432 aa  45.8  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  29.37 
 
 
435 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4560  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.47 
 
 
198 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  34.04 
 
 
420 aa  45.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4213  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.47 
 
 
198 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0284  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.82 
 
 
224 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4366  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.47 
 
 
198 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4701  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.47 
 
 
198 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  29.15 
 
 
398 aa  45.8  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4202  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.47 
 
 
198 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.387044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  26.15 
 
 
984 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  27.45 
 
 
463 aa  45.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.48 
 
 
431 aa  45.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21922  predicted protein  25.14 
 
 
306 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  24.64 
 
 
836 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  22.3 
 
 
971 aa  45.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  24.64 
 
 
836 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  26.98 
 
 
898 aa  45.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>