More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2060 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  100 
 
 		 313 aa  628  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  78.34 
 
 		 314 aa  513  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  46.35 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  41.99 
 
 		 311 aa  252  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  44.09 
 
 		 312 aa  248  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  46.25 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  43.95 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  43.83 
 
 		 294 aa  238  8e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  44.87 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  44.27 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  45.81 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  45.31 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  42.71 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  45 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  44.59 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  66.25 
 
 		 219 aa  230  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  47.44 
 
 		 293 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  47.44 
 
 		 293 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  45.11 
 
 		 309 aa  228  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  44.41 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  44.41 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  44.34 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  42.43 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  42.62 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  44.23 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  44.23 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.81 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  44.44 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  40.58 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  43.04 
 
 		 291 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  42.67 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  44.48 
 
 		 307 aa  222  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  44.16 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  43.59 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  42.17 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  42.86 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  42.49 
 
 		 292 aa  219  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  44.37 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  42.99 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  41.03 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  42.99 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  45.63 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  42.62 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  62.5 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 301 aa  215  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  42.9 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  61.39 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  61.39 
 
 		 250 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  42.63 
 
 		 292 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  45.31 
 
 		 292 aa  212  7.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  41.9 
 
 		 307 aa  212  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  42.9 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  42.9 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  42.72 
 
 		 289 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  42.59 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  42.68 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  44.13 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  38.87 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  43.63 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  42.5 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  43.63 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  40.65 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  43.04 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  43.31 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  42.44 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  64.71 
 
 		 221 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  41.03 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  41.03 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  39.68 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  44.9 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  36.36 
 
 		 355 aa  206  4e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.95 
 
 		 289 aa  206  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  44.01 
 
 		 295 aa  205  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  44.01 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  44.34 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  44.34 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  44.34 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  44.01 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  44.34 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  41.35 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  41.22 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  44.34 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  45.31 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  58.13 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  38.98 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  42.67 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  44.01 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  45.57 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  41.16 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  41.94 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  42.04 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  42.04 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  42.04 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  41.42 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  43.37 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  59.35 
 
 		 218 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>