60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2046 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2046  single-strand binding protein  100 
 
 		 180 aa  364  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377455  normal  0.610609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1502  single-strand binding protein  58.02 
 
 		 165 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3883  single-strand-binding protein  51.58 
 
 		 181 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2913  single-strand binding protein  58.49 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3208  single-strand binding protein  58.49 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3185  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  57.84 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0138929  normal  0.0807912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0526  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  51.4 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07371  single-stranded DNA-binding protein  40.66 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0687  hypothetical protein  39.23 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1671  hypothetical protein  41.44 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0079  hypothetical protein  48.51 
 
 		 148 aa  102  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.998813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05021  single-stranded DNA-binding protein  34.81 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.170532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05291  single-stranded DNA-binding protein  43.56 
 
 		 141 aa  92  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05591  single-stranded DNA-binding protein  42.57 
 
 		 141 aa  91.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05661  single-stranded DNA-binding protein  45.37 
 
 		 149 aa  91.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.621849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1835  single-stranded DNA-binding protein  35.91 
 
 		 145 aa  90.9  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161636  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05601  single-stranded DNA-binding protein  43.56 
 
 		 145 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0125633  normal  0.367261 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0503  hypothetical protein  41.58 
 
 		 141 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  25.74 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  25 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  28.5 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  23.81 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  26.02 
 
 		 146 aa  48.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  23.81 
 
 		 136 aa  47.8  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  25.74 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  29.59 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  23.23 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2461  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  33.33 
 
 		 130 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  29.59 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  24.79 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  29.79 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  24.55 
 
 		 138 aa  45.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  23.53 
 
 		 139 aa  45.1  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  23.08 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  31.91 
 
 		 141 aa  44.7  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  29.59 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  24.75 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  28.83 
 
 		 114 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  28.83 
 
 		 114 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  28.28 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  28.3 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  22.22 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  26.53 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  26.53 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  27.55 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  26.53 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  25.51 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  27.55 
 
 		 193 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  30.19 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  25 
 
 		 147 aa  42  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  28.28 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  26.53 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  22.86 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  26.53 
 
 		 219 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  28.87 
 
 		 187 aa  41.2  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  25 
 
 		 305 aa  40.8  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  27.27 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>