36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1982 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  100 
 
 
322 aa  671    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  36.08 
 
 
321 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  32.91 
 
 
326 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  31.48 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  31.53 
 
 
326 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  29.81 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  29.64 
 
 
329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  26.92 
 
 
338 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  28.78 
 
 
344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  28.16 
 
 
325 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  26.76 
 
 
330 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  23.51 
 
 
324 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  23.84 
 
 
323 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  22.41 
 
 
314 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  23.8 
 
 
745 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.31 
 
 
755 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  23.56 
 
 
769 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  23.43 
 
 
347 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  22.46 
 
 
750 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  22.66 
 
 
751 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  21.75 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  23.75 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  22.12 
 
 
756 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  20.97 
 
 
751 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  21.88 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4335  hypothetical protein  22.81 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0219  terpene synthase family protein  22.02 
 
 
394 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1721  terpene synthase family protein  22.02 
 
 
394 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24708  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1634  terpene synthase family protein  22.02 
 
 
394 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3801  hypothetical protein  21.41 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3530  hypothetical protein  19.33 
 
 
345 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  22.15 
 
 
393 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6509  hypothetical protein  21.58 
 
 
364 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1320  hypothetical protein  21.58 
 
 
364 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.472657  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6100  methyltransferase type 12  21.38 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5945  methyltransferase type 12  19.01 
 
 
677 aa  42.7  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>