More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1962 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  100 
 
 
211 aa  431  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  74.4 
 
 
209 aa  321  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  51.54 
 
 
234 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  54.46 
 
 
225 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  51.46 
 
 
207 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  48.31 
 
 
215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  46.48 
 
 
215 aa  198  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  46.19 
 
 
217 aa  192  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  45.63 
 
 
213 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  45.45 
 
 
217 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  47.64 
 
 
213 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  47.17 
 
 
209 aa  184  6e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  46.7 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  47.52 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  46.46 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  46.41 
 
 
202 aa  181  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  48.74 
 
 
686 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  47 
 
 
707 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  44.5 
 
 
206 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  48.1 
 
 
209 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  44.55 
 
 
688 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  45.97 
 
 
224 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.55 
 
 
212 aa  177  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  177  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  41.55 
 
 
203 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  44.98 
 
 
205 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  43.9 
 
 
688 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  46.04 
 
 
219 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  174  7e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  43.69 
 
 
212 aa  174  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  43.15 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  44.76 
 
 
686 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  43.28 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  42.25 
 
 
217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  45.73 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  44.74 
 
 
214 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  44.78 
 
 
671 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  41.31 
 
 
214 aa  170  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  41.06 
 
 
223 aa  170  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  41.29 
 
 
204 aa  169  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  44.29 
 
 
215 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  41.83 
 
 
212 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  46.38 
 
 
662 aa  168  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  43.43 
 
 
216 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  42.86 
 
 
213 aa  166  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  44.72 
 
 
208 aa  166  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  44.22 
 
 
210 aa  166  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  45.63 
 
 
220 aa  165  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  46.67 
 
 
197 aa  165  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  46.67 
 
 
197 aa  165  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  40.28 
 
 
215 aa  164  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  43.63 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  46.32 
 
 
233 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  44.28 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  43.92 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  43.9 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  46.34 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  44.12 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  43.85 
 
 
705 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  40.65 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  44.16 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.78 
 
 
703 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  39.42 
 
 
212 aa  161  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  38.46 
 
 
212 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  45.63 
 
 
210 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  42.55 
 
 
232 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  40.1 
 
 
217 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  41.4 
 
 
229 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  42.42 
 
 
901 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  41.67 
 
 
226 aa  158  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  45.99 
 
 
213 aa  158  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  43.2 
 
 
215 aa  158  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  46.07 
 
 
225 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  46.6 
 
 
225 aa  157  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  45.02 
 
 
210 aa  157  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  43.16 
 
 
221 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  44.6 
 
 
210 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  43.2 
 
 
281 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  41.15 
 
 
221 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  39.62 
 
 
212 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  45.07 
 
 
210 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  45.99 
 
 
221 aa  155  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  42.44 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  45.11 
 
 
211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  37.44 
 
 
210 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  45.05 
 
 
207 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  41.35 
 
 
234 aa  154  9e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  40.2 
 
 
217 aa  154  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  45.16 
 
 
213 aa  154  9e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  43.4 
 
 
210 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  45.11 
 
 
211 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  38.62 
 
 
210 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  45.5 
 
 
707 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  37.89 
 
 
236 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  42.59 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  40.49 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  37.02 
 
 
212 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  40 
 
 
203 aa  152  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  37.33 
 
 
217 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  38.03 
 
 
212 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>